猕猴脑开放存取数据集

【字体: 时间:2022年03月14日 来源:Netherlands Institute for Neuroscience - KNAW

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  研究人员发布了一个数据集,该数据集是从猴子的视觉皮层在静息状态下记录的。该数据集包括从两只猴子的视觉皮层(V1和V4)记录的电生理数据,在静息状态下同时从1024个记录点记录,还包括猴子执行视觉任务时获得的支持数据集。

  

该数据集包括从两只猴子的视觉皮层(V1和V4)记录下来的电生理学数据,以及在静息状态下1024个同时记录的站点,它还包括猴子执行视觉任务时获得的支持数据集。这些数据以前所未有的空间和时间分辨率,提供了视觉皮层大区域神经元活动的图像,并具有高密度的接受野覆盖。该数据集包括“原始”形式的数据,以实现最广泛的应用,以及处理后的数据,以方便分析常用的神经元信号。

空间和时间上的详细图片

这些记录可以用来观察大脑皮层更大区域的脑电波,提供大脑活动的时空细节图。“在这篇论文中,我们提供了数据集,描述了原始的和处理过的数据格式和数据采集方法,并指出如何使用数据来产生新的见解,对影响我们大脑中视觉信息处理的‘背景’活动,”陈星说。国家科学研究院视觉与认知实验室高级研究员。

大多数研究要么使用核磁共振扫描(一种非侵入性医学成像技术)来检查整个大脑的静息状态活动,要么通过记录少量植入电极的活动。由Pieter Roelfsema教授领导的视觉与认知实验室,对非人类灵长类动物视觉皮层中超过1000个长期植入的电极进行了记录,产生了一个具有高时空分辨率的静止状态数据集——一个非常详细和准确的观察。“我们的部分数据集已经被成功地用于研究通过非侵入性成像获得的大脑活动的神经相关性,”陈说。

开放获取

数据集附带一篇数据描述符文章。这篇文章详细描述了可以从数据、数据格式和数据获取和处理的方法中获得的科学见解。包括数据记录部分(描述数据使用和文件格式);技术验证(验证数据的可用性和正确性);和代码可用性(描述用于数据收集、处理和分析的脚本)。

“这个数据集可以让其他科学家对影响我们大脑视觉信息处理的潜在活动获得新的基础神经科学见解,”陈说。该数据集已在开放获取的知识共享许可下发布,供其他研究人员使用,因此每个人都可以访问数据。

Journal Reference:

  1. Xing Chen, Aitor Morales-Gregorio, Julia Sprenger, Alexander Kleinjohann, Shashwat Sridhar, Sacha J. van Albada, Sonja Grün, Pieter R. Roelfsema. 1024-channel electrophysiological recordings in macaque V1 and V4 during resting state. Scientific Data, 2022; 9 (1) DOI: 10.1038/s41597-022-01180-1

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