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生物学上的衰老:与癌症幸存者过早衰老有关的DNA
【字体: 大 中 小 】 时间:2022年03月24日 来源:St. Jude Children's Research Hospital
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科学家在两个基因中发现了与儿童癌症幸存者加速衰老相关的变异。
今天,美国大多数患癌症的儿童都存活了下来。然而,一些幸存者患上了通常发生在老年人身上的疾病。目前还不完全清楚为什么有些病人比其他人更容易患上与年龄有关的疾病。
流行病学、癌症控制和计算生物学学系的通讯作者王昭明博士说:“这是我的实验室进行的一系列研究之一,目的是调查儿童癌症幸存者的衰老生物标记物。”“我们之前评估了非遗传风险因素,包括癌症治疗、健康行为和导致年龄加速的慢性健康状况。这项研究的重点是这些患者的潜在遗传因素。”
圣裘德研究中心跟踪了6000多名儿童癌症幸存者,这些幸存者被纳入了圣裘德终身队列研究(SJLIFE)。作为SJLIFE的一部分,科学家们通过对幸存者的DNA进行全基因组测序(WGS)来确定遗传变异的特征。Wang的团队分析了来自WGS数据的常见遗传变异与SJLIFE参与者的表观遗传年龄加速(EAA)之间的联系。EAA衡量的是每位幸存者的“生理”年龄和实际年龄之间的差异,它与与年龄相关的疾病的发展密切相关。
在遗传的大海捞针中找到早衰的针
王的团队发现了与加速衰老相关的两个基因组区域的变异。一种是在SELP基因,另一种是在HLA区域。这些基因都与年龄相关的疾病有关。例如,SELP在阿尔茨海默病中上调。
科学家们通过一种不可知的全基因组关联研究(GWAS)方法发现了这些变异。在这项技术中,研究人员比较了存在于生存者和具有不同生物老化水平(即EAA)的社区对照组中的DNA变异。在30亿个碱基对DNA基因组中,检测了超过800万个变异,其中有两个单核苷酸多态性(SNPs),在不同生物衰老水平的个体之间出现显著差异。这些单核苷酸多态性与其他非遗传风险因素相结合,可能使未来的医生能够在出现过早衰老症状之前,识别出那些加速衰老风险较高的幸存者。
“我们的工作可以帮助确定儿童癌症幸存者加速衰老的最高风险亚群,”王说。这些发现还可以为未来的发明研究确定潜在的药物靶点。例如,SELP基因产生的蛋白质,p选择素,已经有一种抑制剂用于其他疾病。”
论文中分析的所有数据都可以向St. Jude Cloud的其他研究人员公开使用,该机构为全球研究界提供了数据和分析资源。
Journal Reference:
Qian Dong, Nan Song, Na Qin, Cheng Chen, Zhenghong Li, Xiaojun Sun, John Easton, Heather Mulder, Emily Plyler, Geoffrey Neale, Emily Walker, Qian Li, Xiaotu Ma, Xiang Chen, I-Chan Huang, Yutaka Yasui, Kirsten K. Ness, Jinghui Zhang, Melissa M. Hudson, Leslie L. Robison, Zhaoming Wang. Genome-wide association studies identify novel genetic loci for epigenetic age acceleration among survivors of childhood cancer. Genome Medicine, 2022; 14 (1) DOI: 10.1186/s13073-022-01038-6tm (accessed March 22, 2022).