快速繁殖的海胆为基因研究提供了新的模式

筑波大学的研究人员建立了海胆物种Temnopleurus reevesii作为基因研究的新模型。与之前被用作生物模型的海胆不同，T. reevesii具有较短的繁殖周期和其他特征，这使它成为基因研究的理想对象。该团队创建了两个基因组数据库，将对许多领域做出贡献，并使未来的研究能够找到一个更好的模型，用于医学和生命科学研究。

　　

日本许多人可能没有意识到，在生物学研究中，不起眼的海胆是一个庞然大物。现在，来自日本的研究人员发现，海胆可以帮助生物学研究走得比以往任何时候都更远。

筑波大学(University of Tsukuba)的研究人员在本月发表于《发育、生长与分化》(Development, Growth and Differentiation)的一项研究中透露，一种特殊的海胆可能会成为游戏规则的改变者，为基因研究开辟了新途径。

海胆作为理解生物系统如何工作的模型已经有一百多年的历史了。这些生物已经使识别生物现象的机制成为可能，从基因调控网络到参与细胞周期的蛋白质。然而，有一个问题——目前使用的模式物种需要2年才能达到生殖成熟，这使得它们不适合进行基因研究。

“为了能够研究海胆的遗传学，我们需要找到繁殖周期较短的物种，或加快当前模式物种的周期，”该研究的资深作者八口俊介教授说。“在我们的研究中，我们寻找的是繁殖周期短的物种。”

研究人员将Temnopleurus reevesii确定为候选物种，因为它只需要6个月就能产生下一代，而且在20°C以上的温度下，可以全年不间断地收集卵子和精子。大多数其他模型海胆没有这些特征，这使得该物种在实验室中培养很有用。

研究小组收集了里氏海胆基因组草案，并构建了TrBase和西太平洋海胆基因组数据库(WestPac-SUGDB)两个基因组数据库，其中西太平洋海胆基因组数据库包含里氏海胆和另一种模式海胆Hemicentrotus pulcherrimus的基因组信息。建立这些数据库的目的是提供遗传信息和建立西太平洋海胆遗传数据门户网站。WestPac-SUGDB也有用于比较两个数据集的搜索程序。

Yaguchi教授说:“我们预计，这些数据库不仅将对海胆基因研究做出贡献，还将对进化研究和比较基因组学做出贡献。”

这项研究的结果为利用T. reevesii作为一个新的模式物种在细胞、发育、实验和进化生物学等多个领域的研究提供了可能。此外，研究人员建议，在不久的将来，调查将发现另一种海胆物种，作为医学和生命科学的改良模式生物。

^{_{原文参考：}}

"TrBase: A genome and transcriptome database of Temnopleurus reevesii," was published in Development, Growth and Differentiation at DOI: 10.1111/dgd.12780