eLife：人类会将肠道微生物传给生活在城市中的野生动物？！

　　

根据发表在《eLife》杂志上的一份报告，生活在城市环境中的野生动物似乎从居住在农村的亲戚那里失踪的人类身上感染了一些肠道细菌。

这份在美国进行的报告的结果表明，城市化对人类和野生动物的影响是平行的，城市中的野生动物获得了一些在城市生活的人类的微生物群中占主导地位的细菌。

生活在脊椎动物肠道中的微生物群落——统称为微生物群落——往往反映宿主有机体的进化史。同一物种的寄主之间的微生物群通常是相似的，而不同物种之间微生物群的不同反映了寄主之间的进化距离。然而，与人类的密切接触会破坏这些关系，导致宿主和微生物进化历史的不匹配，并可能导致肠道和全身其他系统的紊乱。

“随着人类对全球生态系统的影响越来越明显，有必要更好地了解城市化对全球野生动物微生物群的影响，”该研究的主要作者、美国纽约伊萨卡康奈尔大学生态和进化生物学系的博士生Brian a . Dillard解释说。“其他人已经表明，城市化可以改变多种野生动物肠道菌群的组成，导致生活在城市和农村环境的野生动物之间的差异，但我们不知道城市化是否对不同宿主物种的微生物群有类似的影响。”

为了探索这一点，Dillard和他的同事们比较了三种脊椎动物的肠道菌群，城市和农村的种群——顶冠变色蜥蜴(蜥蜴的一种)、郊狼和白冠麻雀——与城市和农村人口的肠道菌群。他们利用新生成的数据以及此前从公共存储库发布的数据集，分析了从94只变色龙、78只土狼和320名成年人的粪便中收集的近500个微生物群的概况。变色龙的样本采集自波多黎各的城市和农村地区，土狼的样本采集自加拿大艾伯塔省埃德蒙顿附近的城市或农村地区，麻雀的样本采集自美国加州旧金山附近的城市或农村地区。人类样本来自马拉维和委内瑞拉的农村社区、美国各地的城市中心、西藏和喀麦隆的城乡社区。

对这些样本进行了基因测序，以确定“扩增子序列变体”，然后可以用来对样本中的微生物区系进行分类。对样本的分析表明，同一物种不同地点的野生动物种群的肠道菌群存在显著差异。事实上，变色龙的微生物群分布在某种程度上反映了它们从城市到农村的距离，城市变色龙的微生物群与人类的微生物群的关系比生活在农村的变色龙的微生物群更密切。同样，城市郊狼的肠道菌群与人类的肠道菌群更相似，而来自农村地区的郊狼的肠道菌群与人类更相似。

接下来，研究小组研究了城市和农村环境中特定微生物丰度的差异，以及野生动物和人类之间是否存在这些差异。在每种情况下，城市和农村人口的细菌数量都不同，野生动物和人类的细菌数量也是如此。在人类中常见的一种叫做拟杆菌的微生物，在城市环境中占人类微生物群的15%，在城市野生动物的粪便样本中也同样占比过高。拟杆菌是一种被认为是人类城市化的已确立指标的微生物，研究人员表示，人类似乎是城市野生动物中这些微生物的来源。

康奈尔大学生态和进化生物学系助理教授、资深作者Andrew H. Moeller总结说:“观察到这些在人类身上发现的细菌谱系在城市野生动物中流行率增加，这与细菌从人类溢出到城市野生动物是一致的。”“微生物的物种间传播可能会对受体宿主产生有害影响，尽管情况并非总是如此。我们仍然不知道这些微生物对城市野生动物有什么影响，如果有的话。很明显，野生动物的微生物群在城市环境中比在农村环境中更类似于人类的微生物群。我们还知道，改变微生物群会影响健康，所以调查对野生动物宿主的后果将是重要的。”

文章标题

Humanization of wildlife gut microbiota in urban environments