蔓菁基因编辑体系新进展：原位杂交最佳固定方式、最佳的探针长度和浓度

相关研究成果以Establishment of Agrobacterium -mediated genetic transformation and application of CRISPR/Cas9 genome-editing system to Brassica rapa var. rapa 为题在国际植物学期刊Plant Methods发表

　　

     原位杂交技术（in situ hybridization）是一项在细胞水平上检测DNA在染色体上的位点或mRNA在组织上表达位置的分子生物学技术。该技术可在保持组织形态完整的情况下在细胞水平上定位特定基因表达位点，因此在研究基因的表达调控部位等方面有优势，并在拟南芥、玉米等物种中的研究中被广泛使用。蔓菁是十字花科芸薹属二年生栽培植物，具有较高的营养和药用价值，而且是研究植物对高原环境适应机制的理想材料。在蔓菁的转化体系尚未完善的情况下，蔓菁原位杂交体系的建立对阐明蔓菁基因功能和表达调控等方面的研究具有重要的意义。 

　　近日，中国科学院昆明植物研究所杨永平研究员带领的植物基因组演化与基因功能发掘团队，确定了。同蔓菁原位杂交最佳固定方式、最佳的蛋白酶K消化时长、最佳的探针长度和浓度时解决了杂交中染色背景过深的问题，优化了RNA探针体外转录体系，成功建立并优化了蔓菁mRNA原位杂交技术。 

　　该成果以“Establishment and optimization of mRNA in situ hybridization system in turnip (Brassica rapa var. rapa)”为题发表在Plant Methods杂志上。上述研究工作得到国家自然科学基金重大项目和云南省自然科学基金等项目的支持。