提高表观遗传时钟的可靠性

【字体: 时间:2022年08月19日 来源:Nature Aging

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  基于DNA甲基化数据的表观遗传时钟是广泛使用的衰老生物标志物,用于评估基于人群的队列的生物年龄。然而,它们的效用受到了技术噪音的限制。在本文中,我们提出了一种方法,产生高可靠性时钟的应用,如纵向研究和干预试验。

  

作者说:“们发现表观遗传时钟可以说你在生物学上是50岁,下一个测试是59岁。我们从现有的常用时钟开始,发现一个单一的变化——增加一种叫做主成分分析的技术——可以在保存老化信号的同时显著降低噪声。现在,对于大多数测试来说,同时进行的两次测量将相差不到一年。这也意味着,一个人的纵向时钟变化更有可能反映真正的生物老化,而不是技术噪音。

基于DNA甲基化数据的表观遗传时钟被广泛使用衰老生物标志物,用于评估基于人群的队列中的生物年龄。然而,它们的效用受到了技术噪音的限制。在本文中,我们提出了一种方法,产生高可靠性的时钟的应用,如纵向研究和干预试验。

生物标记老化评估从细胞、分子、功能和表型测量越来越多地用于研究与人类生物衰老相关的过程。许多研究使用来自全基因组DNA甲基化阵列的所谓“表观遗传时钟”来分析生物衰老与发病率和死亡率之间的关系。虽然这些时钟目前被认为是生物年龄的最佳预测器,但它们仍然包含大量的技术噪声,导致测量的大变异性。

为了使时钟对纵向跟踪和临床干预更有用,改进测量是重要的。在本文中,我们提出了一种方法,其中主成分分析(PCA)来分离噪声从真正的年龄相关信号,从而优先考虑最终时钟中生物学相关的信号。因此,PCA时钟的可靠性比原来的时钟要高得多。

A computational solution for bolstering reliability of epigenetic clocks: implications for clinical trials and longitudinal tracking | Nature Aging


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