大量的植物分子提供了一个简单的“植物区系”数据

　　

日内瓦大学的研究人员建立了一个可搜索的光谱和分子库，收集了1600种植物提取物。这些藏品是通过与皮埃尔法布尔实验室的合作而获得的。由此产生的开放资源发表在GigaScience杂志上，共享所获得的数据和所采用的方法。这将有助于从药物发现到大规模探索植物化学多样性的研究。

植物代谢物在药物开发中发挥着重要作用，因为它们具有很强的生物活性;许多现有药物要么作为纯天然产品使用(例如抗疟疾的青蒿素和抗癌药物紫杉醇)，要么从天然产品中提取(例如抗癌药物长春瑞滨、brentuximab vedotin)。

皮埃尔法布尔实验室一直热衷于与学术界分享其制药经验。例如，抗癌半合成天然产品长春瑞滨(vinorelbine)是从马达加斯加长春花(Catharanthus roseus)中提取的，是与法国国家科学研究中心(CNRS)的Pierre Potier教授合作的结果，于1989年上市。皮埃尔法布尔实验室自创建以来就将植物研究作为其方法的核心方面。在1998年至2015年期间收集了植物样本，主要目标是寻找新的抗癌药物。这个植物样本的收集是世界上最大的私人植物图书馆之一，拥有超过17,000个独特的样本，包括一些稀有物种，涵盖了来自世界各地的各种植物科。自2015年以来，皮埃尔法布尔实验室已向感兴趣的合作伙伴开放其私人植物样本收集。

这项发表在GigaScience上的新研究报告了Pierre Fabre实验室收集的约10%植物提取物的化学特征。这代表着向全世界的研究人员提供完整的化学多样性迈出了重要一步。日内瓦大学的研究人员使用高分辨率质谱法与先进的计算管道相结合，获得了超过200万个光谱和相关化学信息，为植物提取物的生化含量提供了有价值的见解。质谱分析资料和相关元数据已通过海量存储库(登录号MSV000087728)公开共享，本数据说明提供了如何查询这一广泛的管理资源的演示。数据说明共享结果数据和采用的方法，允许再现性，进一步探索数据集和改进拟议的计算工具和方法。这是推进大规模化学多样性数字化领域的一个特殊资源。学术界和工业界之间这种卓有成效的合作关系表明，历史上和私人收集的植物样本的命运是可以改变的，相关化学多样性的丰富性可以为更广泛的公众提供。