基因表达研究揭示了肥胖的新分子关联

【字体: 时间:2023年01月20日 来源:International Journal of Obesity

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  来自科罗拉多大学生物医学信息系的研究人员利用多民族的MESA队列,强调了与体重指数相关的基因表达的新见解。

  

科罗拉多大学医学院生物医学信息系(DBMI)的一项新研究确定了45个基因表达与体重指数(BMI)相关的基因,其中许多基因在肥胖研究中从未被探索过,此前他们进行了一项使用多种族队列的研究。他们发表在《国际肥胖杂志》上的研究“动脉粥样硬化多种族研究中基因表达与体重指数的关系”,指出了肥胖的潜在新生物标志物。这是通过利用最初在2000年收集的一个大型、多样化队列的数据实现的。

“到目前为止,很少有关于BMI的遗传研究在不同祖先的人群中进行,”主要作者卢西亚娜·巴尔加斯解释说。“我们研究的新颖之处在于使用了直接测量的基因表达数据。”

Vargas是一名对个性化医疗感兴趣的CU医学院博士生,他说这些已知的和新颖的基因关联可以为肥胖生物学、潜在的生物标志物和治疗靶点提供见解。

在他们的研究中,DBMI实验室的Ethan Lange博士和Leslie Lange博士利用了动脉粥样硬化多种族研究(MESA)的数据。当MESA启动时,从全国六个实地中心招募了6000多人,研究心血管疾病的风险因素和早期特征。参加者继续定期向外地中心报告收集健康数据。由于研究人群众多,种族多样化,以及收集的健康信息数量众多,研究人员已将其数据用于大量研究。由美国国家心肺血液研究所资助的精确医学跨组学(TOPMed)联盟于2014年启动,开始收集MESA参与者子集以及许多其他队列参与者的基因表达和其他组学数据。

“组学指的是基因、代谢物、蛋白质和RNA等生物分子中可测量的差异或变化。

“我们使用了MESA队列,因为很难找到一个定义明确的队列,有很多良好的临床测量,获得资金,并与研究参与者保持联系,以收集血液,并随着时间的推移进行这些研究,”Iain Konigsberg博士说,他是DBMI Lange实验室的生物医学信息学研究讲师。

研究人员分析了MESA队列中四个自我识别的种族和民族——非洲裔美国人、华裔美国人、西班牙裔美国人和白人——的RNA测序数据,以评估每个基因表达对BMI的影响。许多与心血管风险相关的特征也与肥胖相关,使MESA队列成为肥胖研究的理想选择。

他们发现的45个基因在所有四组中都与BMI相关。虽然通过遗传关联研究已经确定了少数这些基因,但CU的作者报告了许多新的关联。

柯尼斯伯格说,他们的工作表明肥胖研究需要更多的多样性,并希望这项研究的结果能够为更多的下游研究提供信息。他希望继续使用MESA和其他人类队列进行研究。对于Vargas来说,这是合作研究的宝贵经验,她于2021年秋季开始在CU Anschutz攻读人类医学遗传学和基因组学项目的博士生。这是她作为研究生和莱斯利·兰格实验室成员的第一篇论文。

她说:“TOPMed联盟在全美范围内招募了数千人,加入该联盟为研究提供了新的机会。”“我非常欣赏合作的力量。”

文章标题

Gene expression associations with body mass index in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis

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