DepMap计划全面精准打击肿瘤

【字体: 时间:2023年01月20日 来源:broad institute

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  麻省理工学院Broad研究所和哈佛大学的癌症依赖图联盟组件了一个学术-工业合作伙伴计划,于2019年首次宣布,正在加速对肿瘤脆弱性的研究,并确定关键的生物标志物。随着该联盟进入一个新阶段,共有19家制药和生物技术组织参与了该项目。

  

麻省理工学院Broad研究所和哈佛大学的癌症依赖图联盟组件了一个学术-工业合作伙伴计划,于2019年首次宣布,正在加速对肿瘤脆弱性的研究,并确定关键的生物标志物。随着该联盟进入一个新阶段,共有19家制药和生物技术组织参与了该项目。

癌症依赖地图联盟支持Broad的癌症依赖地图(DepMap)计划,该计划旨在通过创建肿瘤脆弱性的全面地图来加速精准癌症医学。DepMap正在使用大规模的功能基因组学和PRISM治疗药物反应分析在大量的癌症模型中创建一个系统的概述,每种癌症的遗传依赖性和复合敏感性,以及指向最有可能受益的患者群体的预测性生物标志物。

Broad核心研究所成员、该研究所癌症项目主任William Sellers表示:“DepMap联盟的再次承诺表明,我们的合作伙伴与布罗德的科学家进行了深入和持续的合作,他们部署了前沿的功能基因组工具,以实现在社区范围内为癌症患者确定最佳治疗靶点的目标。”

DepMap联盟的行业合作伙伴有:

  • AbbVie

  • 安进公司

  • 阿斯利康

  • 拜耳公司

  • Bristol Myers Squibb

  • 勃林格殷格翰集团

  • Calico生命科学

  • 基因泰克公司是罗氏集团的成员

  • 葛兰素史克公司

  • IDEAYA生物科学

  • Incyte

  • 杨森生物科技有限公司

  • Loxo@Lilly

  • 默克公司

  • 奥德赛疗法

  • 辉瑞

  • Repare疗法

  • Scorpion 疗法

  • Servier

在过去的三年中,DepMap联盟合作开发了最全面的资源,通过创建大规模数据集、尖端计算工具和更复杂的可视化工具来识别癌症脆弱性,这些工具共同加速了新靶标和生物标志物的发现。

尽管DepMap资源为联盟和更大的科学界提供了很大的价值,但仍然需要进一步的工作来全面识别癌症的脆弱性。该财团的新战略计划将通过在新领域扩展DepMap来解决这一问题。

DepMap联盟的最新迭代将扩展到包括代表性不足的基因型、罕见癌症和3D患者衍生模型。该研究将纳入新的干扰,如组合CRISPR筛选和生物制剂的筛选,以及新的组学分析模式。新的机器学习方法和改进的计算管道将朝着利用数据发现新的治疗机会的目标发展。

Broad研究所癌症依赖图谱项目主任Francisca Vazquez说:“我对联盟在过去三年中所取得的成就和我们开发的惊人基础设施感到高兴。然而,我们只是触及了表面,我对项目的下一阶段感到兴奋,我们将使用新的筛查和分析方式,加速我们在系统发现癌症脆弱性方面的进展。”

联盟合作伙伴带来了他们的专业知识和观点,同时受益于早期访问数据、门户和工具,并能够使用DepMap数据分析他们的专有数据。

“作为DepMap联盟成员与Broad研究所合作,突出了我们在整个肿瘤学管道中数据驱动药物发现的雄心。勃林格殷格翰全球计算生物学和数字科学主管Jan Nygaard Jensen表示:“此次合作所产生的数据、工具和专业知识对我们的癌症研究项目产生了切实的影响,包括关键优先资产的转化和临床开发方面。”

在接下来的几年里,DepMap联盟将专注于新的技术开发活动,旨在增加癌症依赖图的规模、精度和广度,为未来十年奠定基础。

要了解更多关于癌症依赖地图的信息,请参见癌症依赖地图网页和DepMap门户网站。

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