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PacBio推出三款Kinnex RNA试剂盒,将显著提高RNA测序的通量
【字体: 大 中 小 】 时间:2023年11月06日 来源:PacBio
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这种突破性的试剂盒能够在PacBio长读长测序系统上提高全长RNA、单细胞RNA和16S rRNA测序的通量,推动大规模的研究。
测序公司PacBio近日宣布,它已经开始接受Kinnex RNA试剂盒的订单。这种突破性的试剂盒能够在PacBio长读长测序系统上提高全长RNA、单细胞RNA和16S rRNA测序的通量,推动大规模的研究。
Kinnex试剂盒是基于MAS-Seq方法,将较小的DNA片段连接成较长的可用于HiFi测序的文库。短读长测序难以覆盖整个转录本,而对一条转录本进行长读长测序往往会导致测序能力闲置。有了Kinnex试剂盒,客户可以将转录本连接成长文库进行HiFi测序,从而提高通量,使长读长RNA测序更具成本效益。
新推出的Kinnex单细胞RNA试剂盒以现有的MAS-Seq for Single Cell 3’试剂盒为基础,增加了对10x Genomics 5’试剂盒和文库多重分析的支持。
Kinnex全长RNA试剂盒则通过丰富的信息和灵活的多重分析支持全长RNA测序。利用该试剂盒,Revio系统上每张25M SMRT芯片可产生4000万条读数,Sequel II和IIe系统上每张8M SMRT芯片可产生1500万条读数。此外,整个工作流程还包括使用PacBio的SMRT Link软件进行全长RNA和异构体数据分析。
脊椎动物基因组计划的负责人Erich Jarvis称:“与其前身Iso-seq相比,Kinnex试剂盒现在能够以更高的通量生成HiFi长读长转录组数据,并且是在单细胞水平上生成的。这可以帮助我们更准确地注释基因组组装中的短读长基因区域,并在单细胞分辨率下测量它们的表达水平。”
Kinnex 16S rRNA试剂盒可在任何规模下实现超高分辨率的高质量微生物组测序。有了该试剂盒,Revio系统上每张25M SMRT芯片可产生6000万条读数,Sequel II和IIe系统上每张8M SMRT芯片可产生2500万条读数。它支持对每个文库中的384个样本进行测序,使得全长16S rRNA测序研究更加经济。
Zymo Research公司的微生物组总监Shuiquan Tang博士表示:“有了在PacBio系统上进行全长16S测序的能力,我们能够以比短读长测序更具竞争力的价格向客户提供更高分辨率的物种分类数据。”
PacBio总裁兼首席执行官Christian Henry表示:“Revio系统为HiFi全基因组测序带来了规模。我们的客户要求RNA测序也能达到同样的规模,而这些Kinnex试剂盒每次运行可以提供数千万条全长读数。它将改变RNA测序市场的游戏规则。”
现在有了Kinnex试剂盒产品,客户在Revio测序系统上每年最多可对5200个RNA样本进行测序,每个样本的测序费用低于500美元,与之前的Sequel II和IIe系统相比,样本数量增加了16倍。
PacBio目前已开始接受这三款试剂盒的订单,并将于2023年12月开始发货。