增加了5倍!Cell最新研究发现类病毒环状RNA的奥秘

【字体: 时间:2023年02月02日 来源:Cell

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  来自美国国家医学图书馆(NLM)和合作学术研究机构的一组研究人员开发了一种计算方式,可以识别和更好地理解类病毒体和类似病毒体的共价闭合环状RNA(cccRNA,也被称为环状RNA)

  

来自美国国家医学图书馆(NLM)和合作学术研究机构的一组研究人员开发了一种计算方式,可以识别和更好地理解类病毒和类病毒共价闭合环状RNA(cccRNA,也被称为环状RNA) 这是一种单链RNA,与线性RNA不同,它形成一个共价封闭的连续圈。

研究结果发表在《细胞》杂志上。

类病毒是只有250到400个核苷酸的环状RNA,是已知传染病原体中最小和最简单的,并且一直被认为只在植物中引起感染。人们对类病毒和类病毒RNA的多样性知之甚少,这促使研究人员对这些亚病毒因子及其在其他环境和宿主中的可能丰度进行了更多的研究。

通过搜索5131个元转录组和1344个植物转录组中的类病毒cccRNAs,研究人员发现了11378个类病毒cccRNAs,横跨4409个物种级集群。这一发现与之前发现的类病毒分子相比,增加了5倍。

在这个多样化的集合中,研究人员发现,这种独特的病原体并不像以前认为的那样仅限于传播到少数植物中,而是在各种环境和宿主中普遍存在并大量存在,可与更广为人知的RNA病毒相媲美。此外,科学家们还发现了人类丁型肝炎病毒(D型)的远亲,揭示了这种重要的人类病原体的起源,以及全新的病毒类型。

“这项工作为全世界的研究人员开辟了新的方向,”Eugene V. Koonin博士说,“我们目前正在进行一些后续分析,”他补充说。

要了解有关相关研究的更多信息,请参见NLM Researchers Build Understanding of the Virus Universe Using Metatranscriptome Mining.

文章标题

Mining metatranscriptomes reveals a vast world of viroid-like circular RNAs


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