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MERFISH岂止于新鲜和固定冰冻组织!
【字体: 大 中 小 】 时间:2023年03月27日 来源:
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Vizgen公司的MERSCOPE FFPE solution率先实现了FFPE样品的高度多重、高分辨率、单细胞水平上的空间转录组学分析。
美国Vizgen公司在2021年将MERFISH(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)技术商品化,发布了世界上第一台商品化平台MERSCOPE™超分辨荧光显微成像分析平台。2022年基因有限公司将该平台引入国内推广,并且成为国内首家可以提供MERFISH技术服务的公司。
福尔马林固定、石蜡包埋(Formalin-Fixed and Parrffin Embedded)可以更好的维持蛋白、核酸和组织结构的稳定性,因此是大部分肿瘤组织等样品的常用储存方式。Vizgen公司的MERSCOPE FFPE solution率先实现了FFPE样品的高度多重、高分辨率、单细胞水平上的空间转录组学分析。
• MERSCOPE FFPE样品制备solution提供优化好的protocol和试剂盒,以便助您可靠地进行MERSCOPE上机前的样本制备。
• 兼容的FFPE样本丰富灵活,比如人肺癌、乳腺癌、小鼠小肠等。
• 可快速兼容已有的MERSCOPE平台工作流程。
• 高质量的FFPE样品MERFISH数据,和新鲜冰冻样品以及bulk RNA-seq结果具有较高的一致性。
准确性和灵敏度是高质量的空间转录组学数据的关键特征。MERSCOPE FFPE solution提供了出色的准确性和灵敏度,确保有效的空间转录组数据生成。
FFPE样品MERFISH数据与新鲜样本MERFISH数据具有较好的一致性
FFPE样品MERFISH数据与bulk RNA seq结果具有较好的一致性
MERSCOPE在多种 FFPE 样本中具有高灵敏度和特异性
MERSCOPE FFPE Workflow兼容蛋白染色,最多可检测6种蛋白
目前,Vizgen已经发布了8种人FFPE肿瘤组织MERFISH数据集,点击如下链接免费获取:https://info.vizgen.com/ffpe-showcase?
一、表征乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞类型
二、致密肝癌组织中细胞边界区分允许绘制真正的细胞图谱
三、直观显示乳腺癌感兴趣基因的空间分布
四、乳腺癌细胞类型鉴定和细胞图谱绘制
MERFISH FFPE结肠癌组织应用—揭示肿瘤微环境
通过对结肠癌组织切片进行417个基因的gene panel的检测,可以识别组织内转录不同的细胞类型,包括B细胞、CD8T细胞、NK细胞和巨噬细胞。而通过空间信息,又可以绘制出这些独特免疫细胞的位置,可以看到不同的免疫细胞类型在空间上分布的变化。
不同免疫细胞类型在空间上的分布变化
人结肠癌组织切片中417个基因中的10个RNA亚群
基因有限公司是Vizgen厂家MERSCOPE平台在中国的代理商,负责该系统的售前技术咨询、售后安装培训、应用支持等工作。同时我们也经Vizgen授权在国内开展MERFISH实验服务,老师如果感兴趣的话随时与我们联系!