《Nature Genetics》关注不同种族的基因表达

研究人员是同类研究中规模最大的，主要关注祖先与生物医学特征的相关性，也是第一个研究不同祖先的遗传变异在调节基因表达中的作用的研究。

　　

探索不同的祖先是进一步医学研究的关键因素。科罗拉多大学医学院生物医学信息系(DBMI)的研究人员与加州大学旧金山分校和斯坦福大学合作，在《Nature Genetics》上发表了一项新研究，这是同类研究中规模最大的一项研究，主要关注祖先与生物医学特征的相关性，也是第一个研究不同祖先的遗传变异在调节基因表达中的作用的研究。

“我们正试图了解世界各地的遗传变异如何使我们更深入地了解遗传和RNA水平之间的关系，然后是蛋白质水平和生理学之间的关系，”DBMI副教授和研究的共同资深作者Chris Gignoux博士说。“基因组和基因表达本身只能告诉我们这么多。这些层次结合在一起对我们的帮助更大。”Gignoux将基因表达的遗传控制描述为一个表盘，它控制着转录成RNA和蛋白质水平的基因数量，最终以各种方式影响功能。

该研究分析了非裔美国人和拉丁裔儿童的全基因组和RNA测序。研究人员说，他们的发现证明了在多个人群中测量基因表达的重要性，因为这些基因表达可能因祖先而有很大差异，并使新的发现成为可能，也可能减少历史上代表性不足的人群的医疗保健差距。

Gignoux的实验室使用的数据来自国家心脏、肺和血液研究所资助的精确医学反式组学(TOPMed)联盟和国家人类基因组研究所资助的使用基因组学和流行病学的人口结构(PAGE)研究。他们分析了2733名非裔美国人和西班牙裔/拉丁裔儿童的全基因组和RNA测序数据，探索了全血基因表达遗传结构中的血统和杂合性相关差异。

“我们的最终目标是通过观察来自同一种族群体的人群的基因表达模式来学习，”Chris Gignoux解释说。“来自拉丁美洲各地的个体并不能反映出一个同质的人口，所以这就是为什么不仅仅把拉美裔看作一个群体很重要的部分原因，而是要强调我们可以从研究墨西哥裔美国人和波多黎各人中学到什么，特别是。我们能够利用这种多样性来理解其中的一些模式。”

因为种族是一种社会政治身份，理解基因和祖先之间的关系是相当复杂的，并且在个体之间可能有很大差异。即使在某些人群中，如波多黎各人后裔，也是如此。

从历史上看，对非欧洲血统人群的遗传学研究一直存在缺陷，但更多地了解遗传变异和基因表达之间的关系，可以为许多不同的健康问题提供更深入的研究。

这在医学界对心脏病的认识等例子中得到了证明，几十年来，医学界只关注男性。随着更多的研究，女性的风险因素和症状明显不同。

如果不研究不同的人群，几乎不可能知道一种疾病可能会出现在另一群人中。Gignoux和他的同事们所做的工作，包括来自不同社区的研究人员，可能有助于发现更多对不同人群有重要意义的发现，就像确定女性心脏病发作的不同风险因素一样。

“除非我们去看，否则我们不会知道我们不知道的东西，而这有可能影响我们对许多不同情况和特征的个体风险因素的看法，”Chris Gignoux说。“寻找正确的方式和开发方法也很重要，这样我们就可以利用这些以多样性为重点的努力。我们希望，随着这些举措在遗传和非遗传学科中的进展，有机会提高我们对任何走进诊所的人的生物医学特征的理解。”

Linda Kachuri, Angel C. Y. Mak, Donglei Hu, Celeste Eng, Scott Huntsman, Jennifer R. Elhawary, Namrata Gupta, Stacey Gabriel, Shujie Xiao, Kevin L. Keys, Akinyemi Oni-Orisan, José R. Rodríguez-Santana, Michael A. LeNoir, Luisa N. Borrell, Noah A. Zaitlen, L. Keoki Williams, Christopher R. Gignoux, Esteban González Burchard, Elad Ziv. Gene expression in African Americans, Puerto Ricans and Mexican Americans reveals ancestry-specific patterns of genetic architecture. Nature Genetics, 2023