MERFISH技术商品化后的一年半

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MERFISH技术商品化后的一年半

【字体：大中小】 时间：2023年05月30日 来源：

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　　MERFISH技术至今已经历了8年的科学研究沉淀，自美国Vizgen公司将其商品化并发布MERSCOPE平台至今有一年半载，让我们一起回顾一下MERFISH技术商品化后的这一年半发生了哪些大事！

Vizgen大事纪

01 2022年1月18日，Vizgen在美国首次正式推出了MERFISH技术商品化平台MERSCOPE™，成为世界上第一个单细胞分辨率的原位空间转录组学研究平台——将MERFISH技术与高分辨率成像、流体、图像处理和自动化结合起来。

图1. MERSCOPE是第一个将单细胞和空间转录组学相结合的高度多重、高分辨率的原位基因检测平台。

通过组合标记、多轮成像和稳健的条形码方案，MERFISH技术为转录组的空间分析提供了非常高的检测效率和分辨率，从全组织切片到单细胞甚至亚细胞分辨率成像。

02 2022年，Vizgen继续推出两款新的产品来扩展该平台的功能：9月发布蛋白共检测试剂盒以及11月发布FFPE试剂盒。蛋白共检测试剂盒实现了几百种RNA和6种蛋白质的同时检测，可以更好地研究特定组织区域、细胞类型中基因表达，基于共定位可更好地研究基因的功能。FFPE试剂盒使得更多的研究人员可以从庞大的FFPE样本库中获得空间转录组学数据。

图2. MERSCOPE™数据图像。新鲜冰冻的正常人脑组织切片(A)和患有阿尔茨海默症的老年人脑(B)的MERSCOPE™蛋白共检测数据图像。C.使用500基因panel结合细胞边界染色试剂盒完成FFPE肺癌样本空间图谱分析。D. 固定冰冻的小鼠小肠组织切片的空间图谱分析。如图所示展示出128个基因panel中的8个基因。比例尺为1毫米。

03 MERSCOPE™平台的商业化是推动空间转录组学领域向前发展的一大助力，Vizgen为在这个新的研究领域中处于领先地位而感到自豪。科学研究需要更多的合作和分享，因此截止2022年底，Vizgen共发布了三个MERFISH公开数据集。

1月，Vizgen发布了小鼠肝脏MERFISH数据集，347个基因panel，127万多个细胞，12亿多个转录本。让研究人员对肝脏代谢功能的空间分布有了更加清晰的了解。

5月发布了人8种FFPE肿瘤组织MERFISH数据集，其中包括来自多个器官的肿瘤样本，包括乳腺、结肠、肺、肝、皮肤、前列腺、子宫和卵巢组织。500个基因的panel，869万多个细胞，41亿多个转录本。

小鼠脑受体基因MERFISH数据集，3只小鼠脑组织三个不同部位的9张组织切片，483个脑受体基因panel，73万多个细胞，5亿多个转录本。

目前，Vizgen数据集是世界上最大的单细胞空间转录组学公共数据集，包括26个样本、1000多万个细胞和近60亿个转录本。

图3. MERSCOPE FFPE人类免疫肿瘤学数据发布概述。

数据集获取链接：https://vizgen.com/data-release-program/。

04 在MERSCOPE™的成功推动下，Vizgen获得了8520万美元的C轮融资，至此Vizgen资金总额达到1.362亿美元，成为了最大的专门从事空间生物学的私有企业。Vizgen正在EMA（欧盟）地区扩展业务，并在亚太地区、瑞士和以色列建立了经销商网络。

Vizgen在2022年生物技术突破奖计划中被评为年度最佳生物技术公司，并被确立为单细胞空间转录组学数据的金标准。

到此，2022年圆满结束！

05 2023年3月，Vizgen用两种预制的基因panel新产品的发布开启了新的一年! 为了让用户更快、性价比更高的启动MERFISH实验，Vizgen推出两种预制的基因panel，分别是预制肿瘤通路基因panel和预制神经细胞类型基因panel。两种panel均各自包含500个基因，基于同行发表的高影响力文献和高度引用的数据库精挑细选而来。用户无需花大量时间筛选基因，且货期更短，有大小包装避免不必要的浪费。

06 2023年，基于MERSCOPE™平台发表的文献呈现出爆发式的增长。MERFISH技术应用文献目前累计超过100篇，影响因子10分以上的占90%以上。2023年Q1发表的文章数量已超过2021年全年数量。今年3月，艾伦研究所基于MERSCOPE™平台以及scRNA-seq技术谱出成年小鼠大脑中所有的细胞类型；MERSCOPE™在植物单细胞分辨率的空间转录组学研究领域也开始开花结果。