如何鉴定DNA中的RNA污染

【字体: 时间:2023年07月05日 来源:

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  NanoDrop One/OneC通过内置的Acclaro智能污染物分析功能能够有效的识别DNA中的RNA污染或RNA中的DNA污染,并通过全光谱数据和数据算法校正得到真实的样品浓度。

核酸定量的传统方法是通过测量其在230nm、260nm和280nm处的紫外吸光度,再通过朗伯比尔定律换算得来的。这种方法快速简单准确性高,但是缺乏特异性,因为任何在这些波长处有吸收峰的污染物都会影响到核酸浓度的检测结果。针对这一问题,NanoDrop One/OneC通过内置的Acclaro智能污染物分析功能能够有效的识别DNA中的RNA污染或RNA中的DNA污染,并通过全光谱数据和数据算法校正得到真实的样品浓度。

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将浓度均为250ng/ul的DNA和RNA标准品按不同的比例混合得到8份待测样品。将8份样品按体积等分为两组,第一组8份样品在NanoDrop One上分别重复测量三次取均值,得到Acclaro校正前后的两组数据;第二组8份样品使用dsDNA检测试剂盒进行荧光检测,对比数据见下图1。

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图1:柱状图比较了使用不同方法测量的DNA和RNA混合物的浓度结果。紫色柱状图表示使用dsDNA检测试剂盒的数据(荧光法)。蓝色柱状图表示直接使用A260测量出的DNA浓度。红色柱状图代表理论上的DNA浓度。绿色柱状图代表Acclaro校正后的DNA浓度。误差条表示与平均值的标准差。

当测量含有RNA污染的DNA样品时,仅使用260nm处吸光度来计算DNA浓度会使导致结果偏高,经Acclaro校正后(绿色柱状图),可以得到更为准确的结果,与理论上的DNA浓度(红色柱状图)和荧光法测定的DNA浓度更接近,可见Acclaro智能污染物分析功能能够有效的识别DNA中的RNA污染,并校正得到更真实的DNA浓度。

Acclaro智能污染物分析功能不仅能够识别DNA中的RNA污染或RNA中的DNA污染,还可以识别核酸中的蛋白、胍盐、苯酚等污染物和蛋白中的核酸污染。选择NanoDrop One/OneC进行核酸或蛋白样品浓度质控,您将对自己的模板样品质量更有信心,下游的分子生物学检测结果准确性更有保障!


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