单细胞RNA测序整合分析揭示了五种人类自身免疫性疾病的免疫细胞异质性

　　

在BIO Integration期刊上发表一篇新文章。

自身免疫性疾病是由机体功能部位的免疫反应异常引起的一组疾病。单细胞rna测序(scRNA-seq)技术提供了单细胞分辨率的转录组学信息，从而为自身免疫性疾病的研究提供了新的途径。然而，大多数单细胞RNA-seq研究往往集中在一种自身免疫性疾病上。

scRNA-seq数据来自五种不同自身免疫性疾病(IgA肾病[IgAN]、川崎病[KD]、多发性硬化症[MS]、干燥综合征[SS]和系统性红斑狼疮[SLE])的外周血细胞。对这些数据中的所有免疫细胞进行维度聚类、细胞通讯分析、单核细胞重聚类分析、NK细胞群、差异基因表达分析和功能富集。

对5种不同自身免疫性疾病(IgAN、KD、MS、SS和SLE)外周血细胞的scRNA-seq结果进行整合。所有样本都含有18种不同的免疫细胞亚群，尽管5种疾病的细胞群群不同。通过细胞间通讯网络分析，我们确定IgAN和SLE患者的经典和非经典单核细胞信号显著增强。KD患者na?ve B细胞信号增高。有趣的是，NK和NK- t细胞的信号在SS患者中增强，但在IgAN和SLE患者中降低。经典和非经典单核细胞亚群的转录组学分析进一步显示，促炎细胞因子和干扰素相关基因，包括CCL3、IL1B、ISG15和IFI6，在IgAN和SLE患者中特异性升高。与单核细胞不同，IgAN和KD患者的NK标记基因数量和数量减少，而SS患者的NK标记基因数量增加。同时，两种NK- t细胞亚群仅在SS中发现。

总之，基于单细胞RNA-seq结果的整合，我们证明了五种不同自身免疫性疾病的免疫细胞景观在免疫细胞亚群、群体、差异表达基因和细胞间通讯网络方面的变化。这些数据为进一步探索不同自身免疫性疾病之间的异质性和相似性提供了新的见解。