GMO检测，NanoDrop质控核酸必不可少！

【字体：大中小】 时间：2023年09月28日 来源：基因有限公司

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　　使用 NanoDrop Eight 分光光度计，可以在不到 20 秒的时间内同时测定八个微量样品的 DNA 质量和浓度。Acclaro 技术提供重要的样品污染物信息，确保提取方案和后续 qPCR 成功运行，保障得到高质量的结果。

当利用 qPCR 进行转基因生物检测时，数据可靠性是重中之重，因为食品和饮料产品必须符合政府对转基因生物的法规要求。制备用于 qPCR 分析的 DNA 需要极高的纯度和准确的浓度。使用 NanoDrop Eight 分光光度计，可以在不到 20 秒的时间内同时测定八个微量样品的 DNA 质量和浓度。Acclaro 技术提供重要的样品污染物信息，确保提取方案和后续 qPCR 成功运行，保障得到高质量的结果。

转基因生物的检测

通过多重qPCR检测转基因，其中靶点是花椰菜花叶病毒35S启动子（P35S/CaMV）、根癌农杆菌（Agrobacterium tumefaciens）合成酶终止子（TNOS/A）和艾草花叶病毒34S启动子（P34S/FMV）。为了确定模板DNA的浓度和质量，Thermo Scientific™ NanoDrop Eight超微量紫外可见分光光度计计算核酸浓度并识别其中污染物。通过化学计量算法，Thermo Scientific™Acclaro™智能样品检测技术可提供有关样品污染物的信息，提高样品检测效率。

图1: NanoDrop Eight操作软件内置的Acclaro技术。鉴定污染物为苯酚，并报告其对吸光度的影响。计算校正后的DNA浓度，紫色为校正后的光谱。

常见的PCR抑制剂是残留的提取物质，如蛋白质和苯酚，可以用NanoDrop Eight软件内置的Acclaro™智能样品检测技术进行鉴定。从食物中提取核酸时由于蛋白质含量丰富，往往会被共提取。污染的蛋白质会抑制PCR中的DNA聚合酶，降低PCR的效率，使用NanoDrop Eight可以识别污染物并对提取方案进行简单的修改，而无需在PCR效率较低时进行大量的故障排除。

NanoDrop Eight质控CTAB法提取的
豆类样品中的DNA

使用CTAB法提取DNA，应用qPCR检测与GMO筛选试剂盒，Thermo Scientific™ TaqMan™转基因生物筛选试剂盒用于检测食品和饲料样品中DNA提取物中是否存在转基因生物。将豆腐、豆浆、毛豆和大豆的DNA样品稀释至20 ng/μL，然后进行qPCR实验，对结果进行分析。

按照CTAB提取方法，用NanoDrop Eight超微量紫外分光光度计检测豆腐、豆浆、毛豆和大豆的DNA浓度和纯度。DNA提取量高，所有样品均接近100 ng/μL。所有样品都具有优异的纯度，A260/A280的纯度比在1.85至1.90之间，没有任何Acclaro污染物警示。

图2: NanoDrop Eight报告的使用CTAB法提取DNA的DNA浓度（ng/μL）和A260/A280纯度比。

表1列出了存在-缺失分析qPCR的结果。所有样品的植物内源对照和内部阳性对照(IPC)均呈阳性，表明样品为植物来源，不存在PCR抑制剂。豆腐和豆浆DNA均未检测到CaMV, A. tumefaciens, 和 FMV.。毛豆和大豆DNA检测P34S和FMV阳性，表明FMV天然存在，没有特异性的转基因物质。大豆DNA也检测出P35S和CaMV阳性，表明CaMV天然存在，没有特异性的转基因物质。

表1: 使用TaqMan转基因筛选试剂盒进行qPCR后，在Thermo Fisher Connect平台上进行存在-缺失分析qPCR应用的结果。

对于毛豆和大豆，下一步将使用大豆特异性内源对照的qPCR相对定量曲线来进一步证实这些发现并量化靶基因拷贝数。在进行定量曲线时，样品的纯度至关重要，这对于高度加工的食品样品来说可能是一个挑战，由于PCR抑制剂的存在或不准确的模板量导致的定量周期的轻微变化对靶基因定量有相当大的影响。在进行定量曲线之前使用NanoDrop Eight仪器将为qPCR结果增加准确性。

NanoDrop Eight，仅需要1-2μL上样量，支持8个样品同时检测，20s内得出结果，多种质控方法可供选择。

1. 内置Acclaro™智能样品检测技术，可以分析核酸中的蛋白质、苯酚、盐酸胍、胍盐等污染，自动计算并校正给出真实的核酸浓度。

2. 可选FDA 21 CFR Part11软件，满足合规性要求。

3. 另外还支持蛋白浓度和光谱扫描等应用。

NanoDrop Eight超微量分光光度计

基因有限公司自2004年成为NanoDrop公司(现Thermo公司)在中国区的合作伙伴，至今有近20年的合作历史，负责NanoDrop全系列产品线的售前咨询、售后安装、应用培训和维修维护等服务。目前在中国有数万台装机，服务了几十万用户。

基因有限公司成立于1992年，是一家提供生命科学科研仪器、试剂耗材和技术服务的综合服务商。基于“Gene Brightens Every Life•BioTech Connects the World“---“基因燃亮生命•生物技术连接世界”的愿景，专注于生命科学领域前沿技术的引进和推广，致力于推动该领域国内科研机构硬件水平及实验方案的革新与升级。同时，公司也一直致力于自主品牌的科研设备的研发与生产，拥有一系列通用性强、互补性高的自主品牌产品。公司的服务网络遍及全国各地十多个大中城市，拥有包括仪器销售，试剂与耗材销售，市场与技术支持，维修，客服，物流等多个部门组成的完整服务体系。我们希望通过不懈努力，为您的成功铺路搭桥，也为中国的生命科学事业赶超世界先进水平尽一己之力。欲了解更多信息，请访问www.genecompany.cn。