Curio Biosciences推出高分辨率的空间转录组分析技术

2019年，一项名为Slide-seq的空间转录组分析技术在《Science》杂志上发表。四年后，这项技术被商业化，由Curio Biosciences公司推出。这就是Curio Seeker空间分析试剂盒。

2019年，一项名为Slide-seq的空间转录组分析技术在《Science》杂志上发表。这项技术由Broad研究所的Fei Chen和Evan Macosko等人开发，能够以单细胞水平的分辨率获得空间解析的基因表达数据。

四年后，这项技术被商业化，由Curio Biosciences公司推出。这就是Curio Seeker空间分析试剂盒。它能够以出色的分辨率对新鲜冷冻组织切片进行全转录组空间分析，并直接整合到现有的测序流程中。

Curio Seeker利用带有空间条形码的单层10 μm微珠来捕获RNA，从而保留转录组的空间信息。在捕获后，RNA经历了逆转录、文库制备和测序等过程。之后可通过Curio Seeker的生物信息学流程来处理数据，生成一张高分辨率的空间转录组图谱。

这个流程简单、易上手，只需要使用标准的分子生物学技术和仪器，无需特殊的设备，也无需显微镜操作经验。利用Curio Seeker生成的空间转录组数据，研究人员能够更好地了解细胞在其原生环境中的功能，获得单细胞测序方法无法提供的生物学见解。

最初，Curio Biosciences公司推出了3x3的空间分析试剂盒，能够分析3 mm x 3 mm大小的区域。去年9月，他们又推出了10x10试剂盒，将分析范围扩大到10 mm x 10 mm的区域。据介绍，这种更大的形式有助于对人体组织样本以及模式生物的全器官样本进行研究。

哈佛大学干细胞与再生生物学系助理教授Fei Chen表示：“Curio Seeker 10×10试剂盒提供的数据点数量大大超过了最初的Slide-seq技术。它将高分辨率、全转录组和空间生物学进一步带入人类生物学研究领域，使得研究人员能够观察组织样本中更大的感兴趣区域。”

康奈尔大学是该公司的早期用户之一。Iwijn De Vlaminck副教授的实验室正利用Curio Seeker试剂盒开展空间转录组学研究，分析病毒性心肌炎和病毒性脑炎的发病机制、鸡心脏的发育以及与排卵相关的分子过程。

“高分辨率的空间RNA测序是绘制和研究生物学的一种强大方法。全新的Curio Seeker 10×10试剂盒是一种非常有用的工具，可释放这种新方法的真正潜力，它让我们能够利用现有的测序仪，在更大的组织切片上生成更多无偏的高分辨率空间转录组学数据，而这是其他方法无法实现的，”Iwijn De Vlaminck谈道。

Curio Seeker空间分析试剂盒可应用在多个领域，从发育生物学到病毒免疫学。有了这项技术，研究人员能够更好地了解发育过程中以及健康和病变状态下各个生物系统中的复杂细胞环境。例如，他们可以确定哪种免疫细胞存在于肿瘤微环境中及其具体位置如何，这有助于了解癌症复发和转移过程中的免疫逃逸机制。