血癌细胞的表观遗传图谱

　　

近年来，生物医学实验室的研究发生了重大变化，以至于在许多情况下，试管已经让位于计算机。在这种背景下，现在的许多发现都是从对分子和细胞数据库的详细研究开始的，然后通过经典的白大褂实验来验证和扩展这些发现，最后通过将这些知识转化为临床环境，这要归功于医院里的白大褂专业人员。所谓的“数据库工程”为许多计算机科学家和数学家打开了生物医学研究的大门，他们经常在这个棋盘上扮演重要角色。

今天，由Josep Carreras白血病研究所（IJC） ICREA研究教授、巴塞罗那大学医学院遗传学主席Manel Esteller博士领导的一篇文章发表在《Leukemia》杂志上，该杂志是《自然》杂志的子刊，通过向科学界提供来自各种恶性血液疾病及其相关器官（如白血病和淋巴瘤）的200多种细胞系的表观遗传图谱，提供了生物信息学力量的新例子。这项研究由Aleix Noguera-Castells博士首次撰写，并与约瑟夫·卡雷拉斯研究所的Josep Maria Ribera's博士的实验室合作。

Esteller博士解释说，该团队已经获得了“迄今为止从血液、骨髓和淋巴结中的转化细胞中提取的最广泛的培养细胞的表观遗传谱，检查了其中超过80万个由于DNA甲基化而导致的基因组修饰位点”。这包括人类和小鼠的恶性样本，使得获得的模式对基础、应用和临床研究人员都有潜在的用处。

Esteller还强调，“特别重要的一点是，我们获得的表观基因组与患者原发肿瘤的表观基因组非常相似”，这意味着，当对血癌的身份和分类存在疑问时，使用计算算法，这个数据库可以作为诊断血癌的参考。“我们之前已经证明了这种方法在脑肿瘤和肉瘤中的成功，”Esteller博士提醒道。

除了对恶性细胞表观基因组的纯粹表征外，该研究还将表观遗传数据与300多种药物的敏感性信息进行了交叉参考，因此“现在，一种单独的算法可以预测哪种表观遗传病变与药物的敏感性或耐药性有关”，这是临床研究的一个重要里程碑。

加上数据的广泛可用性，上传到在线公共存储库，研究小组相信，报告的与药物敏感性相关的特征将是正确识别未知来源的肿瘤和帮助决定最佳治疗选择的宝贵资产。