相对于热点,基因组中的突变冷点有哪些特征?

【字体: 时间:2024年04月12日 来源:AAAS

编辑推荐:

  巴塞罗那生物医学研究所的研究人员报告了人类基因组的突变率变化。低突变率的区域与低甲基化有关,这是细胞控制基因开启或关闭的一种方式。

  

随着人体细胞的复制、生物体的生长以及衰老,突变也在不断发生。一些突变,尤其是发生在基因中的突变,可能在癌症的发展过程中起重要作用。因此,人们需要将可能造成疾病的突变与不会造成任何后果的突变区分开来。

人类基因组的局部突变率具有高度异质性,目前了解较多的包括Mb大小的染色体变化,以及另一个极端的寡核苷酸变化。然而,对于kb大小的突变风险异质性,目前还了解不多。

巴塞罗那生物医学研究所的研究人员近日分析了数千个体细胞基因组,研究了基因体(约1-10 kb)的突变风险梯度。这项研究的成果于4月8日发表在《Nucleic Acids Research》(核酸研究)杂志上。

通过这项研究,Fran Supek博士和David Mas Ponte博士确定了突变负荷比较低的“冷点(coldspot)”,并将其与低的DNA甲基化相关联,从而建立了与突变调控相关的直接机制。

Supek博士表示:“了解突变率的分布可以促进靶向疗法的发展,以保护特定的基因组区域,或促进诊断工具的开发,以便监测这些区域。这类疗法有助于防止驱动癌症进展的突变的积累。”

研究人员发现,对于基因体而言,主要的异质性涉及到5’末端的数千个碱基,这些碱基通常是低突变的,并带有几种突变特征,其中最突出的是CpG二核苷酸上普遍存在的C > T变化。这种低突变位点对应于活性基因以及增强子等功能元件中的DNA低甲基化。

DNA甲基化是一个天然过程,可影响基因的活跃程度,它是最常见的表观遗传学改变之一,对活性基因尤其重要。与发生在基因大片段上的其他组蛋白修饰不同,DNA甲基化模式在基因的短片段上各不相同,因此在定量基因组和邻近调控区域的突变率变化时,DNA甲基化也有一定的相关性。

Supek博士总结道:“这项研究帮助我们了解导致基因内突变分布不均匀的因素,为突变机制和癌症进化提供了有价值的见解。”


相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号