解码发育:mRNA在胚胎形成中的作用

【字体: 时间:2024年05月09日 来源:AAAS

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  希伯来大学的一项新研究揭示了胚胎发育过程中mRNA调控的见解。该研究结合了斑马鱼胚胎的单细胞RNA-Seq和代谢标记,区分了新转录的和预先存在的mRNA。该方法量化了单个细胞类型中的mRNA转录和降解率,揭示了不同基因之间的调节率和细胞类型特异性降解差异。了解胚胎发育过程中mRNA的调控有助于破译特定细胞中基因是如何在精确的时间开启和关闭的,从而使我们了解发育、细胞命运决定以及在医学和生物学中的潜在应用。

  

希伯来大学的一项新研究揭示了胚胎发育过程中mRNA调控的见解。该研究结合了斑马鱼胚胎的单细胞RNA-Seq和代谢标记,区分了新转录的和预先存在的mRNA。该方法量化了单个细胞类型中的mRNA转录和降解率,揭示了不同基因之间的调节率和细胞类型特异性降解差异。了解胚胎发育过程中mRNA的调控有助于破译特定细胞中基因是如何在精确的时间开启和关闭的,从而使我们了解发育、细胞命运决定以及在医学和生物学中的潜在应用。

在希伯来大学亚历山大·西尔伯曼生命科学研究所研究员迈克尔·拉巴尼博士的指导下,由博士研究生Lior Fishman和团队领导的一项新研究,与美国国立卫生研究院的研究人员合作,揭示了胚胎发育过程中mRNA调控的复杂过程,为多能细胞如何通过基因表达采用特殊身份提供了新的见解。

胚胎发育涉及多能细胞,通过采用特定的基因表达谱来获得特殊的身份。然而,理解mRNA转录和降解对形成这些特征的相对贡献一直具有挑战性,特别是在具有不同细胞身份的胚胎中。

在这项研究中,研究人员使用了一种称为单细胞RNA测序的技术以及代谢标记来跟踪斑马鱼胚胎中基因是如何随着时间的推移而开启和关闭的。他们可以区分新生成的mRNA(来自胚胎本身)和已经存在的mRNA(来自母亲)。利用数学模型,他们测量了不同类型细胞在发育过程中基因开启和关闭的速度。

研究结果揭示了数千个基因之间高度不同的调控率。研究人员观察到许多转录本的协调转录和破坏率,并将降解差异与特定序列元素联系起来。重要的是,他们发现了细胞类型特异性降解的差异,包括原始生殖细胞和包膜层细胞中母体转录物的选择性保留,这是两种最早的特定细胞类型。

该研究的资深作者Michal Rabani博士评论说:“我们的研究提供了一种定量方法来研究动态时空反应中的mRNA调控。这项工作为理解胚胎发育过程中细胞命运决定的分子机制开辟了新的途径。”

本研究的发现有助于更深入地了解mRNA调控及其在胚胎发育过程中塑造细胞身份的作用。研究小组希望他们的工作将为未来的研究铺平道路,旨在揭示各种生物背景下基因表达调控的复杂性。

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