重大发现!FUT10 和 FUT11 改写蛋白质 O - 岩藻糖基化认知版图

【字体: 时间:2025年01月23日 来源:Nature Chemical Biology 13

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  在蛋白质 O - 岩藻糖基化研究领域,此前仅知 POFUT1 和 POFUT2 参与特定结构修饰。为探究新的修饰机制,研究人员开展 FUT10 和 FUT11 功能研究。结果发现二者是修饰蛋白 EMI 结构域的 POFUTs,参与非经典内质网质量控制。这拓展了 O - 岩藻糖基化认知,意义重大。

  在生命科学的神秘世界里,蛋白质的修饰过程就像一场精密的分子舞蹈,其中蛋白质 O - 岩藻糖基化(Protein O-fucosylation)扮演着至关重要的角色。它参与了众多关键的生物学事件,从细胞的生长发育到疾病的发生发展,都有它的身影。此前,科学家们已经发现了蛋白质 O - 岩藻糖基转移酶 1(POFUT1)和蛋白质 O - 岩藻糖基转移酶 2(POFUT2),它们分别对表皮生长因子样重复序列(EGF-like repeats)和血小板反应蛋白 1 型重复序列(TSR)进行 O - 岩藻糖基化修饰,并且这些修饰与多种人类先天性疾病和癌症密切相关。然而,随着研究的深入,新的问题浮出水面:在 Multimerin-1(MMRN1)的弹性蛋白微原纤维界面(EMI)结构域上,发现了一种未被解释的 O - 岩藻糖基化修饰,它既不符合 POFUT1 的修饰模式,也与 POFUT2 的作用机制不同,那么究竟是哪种酶在背后操控这一修饰过程呢?这个谜团吸引着科学家们不断探索,也为新的研究拉开了序幕。
为了解开这个谜团,来自美国佐治亚大学复杂碳水化合物研究中心(Complex Carbohydrate Research Center, University of Georgia)和澳大利亚悉尼大学等多个研究机构的研究人员携手合作,展开了一项深入的研究。他们通过一系列严谨的实验,最终发现 FUT10 和 FUT11 实际上是负责修饰 EMI 结构域的蛋白质 O - 岩藻糖基转移酶(POFUTs),并将其重新命名为 POFUT3和 POFUT4。这一发现不仅拓展了蛋白质 O - 岩藻糖基化的研究领域,还为深入理解相关生物学过程和疾病机制提供了新的线索。该研究成果发表在《Nature Chemical Biology》上,引起了科学界的广泛关注。

在这项研究中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先是基于 AlphaFold2 的蛋白质结构预测和相互作用分析,这一技术帮助研究人员从分子层面预测 FUT10、FUT11 与 EMI 结构域之间的相互作用,为后续实验提供了重要的理论依据。其次,利用共免疫沉淀技术(co-immunoprecipitation)验证了它们之间的相互作用,直观地展示了这些蛋白质在细胞内的结合情况。此外,质谱分析(mass spectrometric analysis)在研究中发挥了关键作用,通过对蛋白质糖基化修饰的精确检测,确定了 O - 岩藻糖基化的位点和修饰程度。同时,CRISPR-Cas9 基因编辑技术构建基因敲除细胞系,明确了 FUT10 和 FUT11 在 O - 岩藻糖基化过程中的具体作用。

研究结果主要通过以下几个方面得出:

  1. 确定修饰酶:研究人员通过在不同基因敲除的 HEK293T 细胞中表达 MMRN1,利用质谱分析发现 POFUT1 和 POFUT2 均不负责 MMRN1 EMI 结构域的 O - 岩藻糖基化。接着,借助 AlphaFold2-multimer 预测,发现 FUT10 和 FUT11 与 EMI 结构域有很强的相互作用,且通过共免疫沉淀实验进一步验证了这种相互作用。随后的体外酶活实验表明,FUT10 和 FUT11 能够独立地为 EMI 底物添加岩藻糖,且具有时间依赖性,从而确定它们是修饰 EMI 结构域的 POFUTs。
  2. 酶活性分析:对 FUT10 和 FUT11 进行动力学分析,发现它们修饰 T216 和 T265 位点的催化机制相似,但 T216 位点的 Km(底物浓度在反应速度达到最大反应速度一半时的浓度)和 Vmax(最大反应速率)值比 T265 位点高。同时,GFP-FUT10 的总体活性显著高于 GFP-FUT11,但在低 EMI 底物浓度下,GFP-FUT11 在 T216 位点的活性略高,在 T265 位点活性相似。
  3. 细胞内功能验证:通过 CRISPR-Cas9 技术构建 FUT10、FUT11 单敲除和双敲除的 HEK293T 细胞系,发现敲除 FUT10 或 FUT11 会显著降低 MMRN1 EMI 结构域的 O - 岩藻糖基化水平,双敲除则完全消除该修饰,而过表达 FUT10 或 FUT11 可恢复修饰,证明二者在细胞内负责 EMI 结构域的 O - 岩藻糖基化。
  4. 修饰特性及细胞定位:研究发现 FUT10 和 FUT11 仅修饰折叠的 EMI 结构,且定位于内质网而非高尔基体。通过突变 MMRN1 的 O - 岩藻糖基化位点和在 FUT10/11 双敲除细胞中进行分泌实验,证实 O - 岩藻糖基化对 MMRN1 的分泌有重要影响,表明 FUT10 和 FUT11 参与内质网的质量控制,确保含 EMI 结构域蛋白的正确折叠和分泌。

研究结论和讨论部分指出,FUT10 和 FUT11(POFUT3和 POFUT4)是修饰 EMI 结构域的新型 POFUTs,它们在体外和细胞内都具有很强的 O - 岩藻糖基转移活性。与 POFUT1 和 POFUT2 类似,POFUT3和 POFUT4依赖折叠的 EMI 结构进行修饰,并参与内质网的非经典质量控制途径。这一发现纠正了此前对 FUT10 和 FUT11 功能的错误注释,拓展了蛋白质 O - 岩藻糖基化的研究范畴。同时,研究还发现 POFUT3和 POFUT4在脊椎动物发育中具有重要功能,其异常表达与肿瘤发生相关,这为研究胚胎发育、肿瘤发生和干细胞维持等生物学过程提供了新的靶点和理论依据,有望推动相关疾病的诊断和治疗研究取得新的突破,在生命科学和健康医学领域具有重要的意义。

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