创新构建：核糖体合成与翻译后修饰肽的从头设计策略

在自然界中，肽经酶修饰以约束结构并引入功能基团。但组合不同途径的酶构建新肽结构，其使用规则难以确定。研究人员开展核糖体合成与翻译后修饰肽（RiPP）相关研究，建立生物物理模型组合酶，成功设计并修饰多种肽，为酶修饰肽及文库设计提供范例。

　　在自然界中，肽会在酶的作用下发生修饰，从而限制其结构并引入功能性基团。通过组合来自不同途径的酶，本可以构建全新的肽结构，然而，确定这些酶的使用规则却困难重重。为此，研究人员提出了一种生物物理模型，用于组合源自细菌核糖体合成与翻译后修饰肽（RiPP）基因簇的酶。利用一套流程评估了 1000 多种肽，该模型在大肠杆菌中，针对不同类别的酶（graspetide、spliceotide、pantocin、cyanobactin、glycocin、套索肽（lasso peptide ）和羊毛硫肽（lanthipeptide））在统一条件下进行了参数设定。研究人员设计了带有多达三种酶识别序列的合成前导肽，以修饰与天然 RiPPs 没有相同序列的核心序列。经实验验证，具有预期修饰的 RiPPs 占所产生的总肽的 7 - 67%，在 8 种肽设计中，有 6 种成功实现了修饰。这项工作是酶修饰肽及文库设计的范例，其所用的框架可进一步拓展，纳入新的酶和化学基团。