定量 RNA 假尿苷图谱揭示植物通过 rRNA、tRNA 和 mRNA 假尿苷化实现的多层翻译调控意义重大
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时间:2025年01月23日
来源:Nature Plants 15.8
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假尿苷(Ψ)研究受限于缺乏全面分析方法。研究人员开展植物转录组假尿苷图谱相关研究,发现 rRNA、tRNA 和 mRNA 的 Ψ 修饰可多层调控翻译效率。该研究为植物 Ψ 研究提供资源,意义重大。
假尿苷(Ψ)是最为丰富的 RNA 修饰类型,然而,由于缺乏可靠的方法来绘制全面的 Ψ 图谱,对 Ψ 的研究一直受到阻碍。在此,研究人员利用亚硫酸氢盐诱导的缺失测序技术,在多种植物物种中生成了单碱基分辨率的转录组范围的 Ψ 图谱。通过整合核糖体 RNA(rRNA)、转运 RNA(tRNA)和信使 RNA(mRNA)的 Ψ 化学计量学数据,以及 mRNA 丰度和多聚核糖体分析数据,研究人员揭示了通过 Ψ 修饰对翻译效率的多层调控机制。rRNA 假尿苷化能够在全局层面控制翻译过程,尽管不同 rRNA Ψ 位点的影响存在差异。tRNA T 臂环中的 Ψ,其化学计量与各自密码子的翻译效率之间呈现出强烈的正相关。研究人员观察到,在拟南芥幼苗中,Ψ 水平与 mRNA 稳定性通常呈负相关,但与翻译效率呈正相关。总之,该研究为植物 Ψ 研究提供了关键资源,并揭示了 rRNA、tRNA 和 mRNA 假尿苷化在翻译调控中的普遍作用。
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