Park7 基因缺失引发的性别特异性转录组变化:帕金森病研究新突破

【字体: 时间:2025年01月23日 来源:npj Parkinson's Disease 6.7

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  帕金森病(PD)临床诊断依赖运动症状,男性患病率更高。为探究 DJ - 1 缺失早期分子变化,研究人员对 Park7-/-小鼠进行研究。发现 Park7 缺失导致雄性中脑出现性别特异性基因表达变化,通过 NRF2 - CYP1B1 轴影响相关通路,这有助于理解 PD 机制及性别差异。

  帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一种常见的神经退行性疾病,严重影响患者的生活质量。目前,PD 的临床诊断主要依赖特定的运动症状,但许多非运动症状,如嗅觉减退、抑郁、焦虑等,可能在疾病确诊前 20 年就已出现。而且,PD 在 65 岁以上人群中的发病率不断上升,男性的患病率和发病率均高于女性。其中,中脑黑质致密部(substantia nigra pars compacta,SNpc)多巴胺能神经元的进行性丧失是 PD 的主要神经病理特征之一,氧化应激和线粒体功能障碍在这一过程中起着关键作用。
DJ - 1(由 Parkinsonism associated deglycase 或 PARK7 编码)是常染色体隐性遗传性早发性 PD 的致病基因,其功能丧失突变会导致 DJ - 1 蛋白功能缺失或减少。此前,利用小鼠和人类细胞系的研究表明,DJ - 1 能通过抑制 NRF2 与 KEAP1 的相互作用来稳定 NRF2。然而,关于 Park7 基因敲除小鼠模型在研究 PD 方面的结果并不一致,且部分研究未明确实验动物的性别,而性别可能是影响实验结果的关键变量。

为了深入了解 DJ - 1 缺失在体内引发的早期事件以及可能存在的性别特异性差异,卢森堡大学(University of Luxembourg)等机构的研究人员开展了一系列研究。他们的研究成果发表在《npj Parkinson's Disease》上,为理解 PD 的发病机制和性别差异提供了重要线索。

研究人员运用了多种关键技术方法。首先是 RNA 测序(RNA - seq)技术,对不同年龄、性别的 Park7-/-小鼠和野生型小鼠的中脑样本进行转录组分析,以确定基因表达的变化。其次,采用 RNA 干扰(RNAi)实验,在原代星形胶质细胞中敲低相关基因,研究基因之间的调控关系。此外,还利用免疫细胞化学、RNAscope 检测等技术,对基因表达和蛋白定位进行验证。实验样本包括小鼠的中脑、皮质组织,以及原代培养的星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞前体等,同时使用了携带 PARK7 突变的人类诱导多能干细胞(iPSC)衍生的星形胶质细胞。

研究结果如下:

  • Park7 缺失诱导 8 月龄雄性小鼠中脑转录组变化:研究人员解剖 3 月龄和 8 月龄的 Park7-/-小鼠和野生型同窝对照小鼠的中脑,提取总 RNA 进行 RNA - seq 分析。结果发现,3 月龄时,雄性和雌性小鼠中差异表达基因(DEGs)较少;而 8 月龄时,雌性小鼠中 DEGs 增加到 101 个,雄性小鼠中则检测到超过 1200 个 DEGs,且变化幅度更大。进一步分析确认,746 个主要下调的 DEGs 存在于雄性小鼠中,且与雌性小鼠的 DEGs 重叠较少,表明 Park7 缺失导致中脑出现性别特异性基因表达变化,雄性受影响更明显。
  • 雄性小鼠中 DJ - 1 缺失下调与上皮 - 间质转化、粘着斑和细胞外基质组成相关的基因:对雄性小鼠中 746 个 DEGs 进行富集分析,发现粘着斑在多个数据库中均为最富集的通路,细胞外基质(ECM) - 受体相互作用、ECM 调节等也在前列,同时上皮 - 间质转化(EMT)过程显著富集。与 EMT 相关的 58 个基因在雄性 Park7 小鼠中几乎都下调,如 E - cadherin(Cdh1 编码)和 Twist1 等,且这种下调在雄性中脑得到 RT - qPCR 和 RNAscope 验证,而在雌性或雄性皮质中未观察到。
  • Park7 小鼠的性别特异性变化与 NRF2 信号降低有关:通过分析已知转录因子(TF)的靶基因,发现雄性 DEGs 中 NRF2(由 Nfe2l2 基因编码)的主要靶基因显著富集,且多数下调并与 EMT 过程相关。同时,抗氧化反应基因在 Park7 小鼠中下调,Nfe2l2 本身也有下调趋势,通过 RT - qPCR 和 RNAscope 验证了部分抗氧化基因和 Nfe2l2 在雄性中脑的下调,表明 NRF2 可能介导 DJ - 1 诱导的转录变化,导致 NRF2 介导的信号和抗氧化反应总体下降。
  • 基因表达变化具有性别特异性:利用 Ingenuity Pathway Analysis(IPA)工具预测上游调节因子,发现 β - 雌二醇是解释雄性小鼠基因表达变化的主要上游调节因子,而雌性小鼠中未观察到。8 月龄野生型雄性和雌性中脑的差异基因表达分析显示,许多受 Park7 缺失影响的基因在基线时就存在性别差异,且野生型雄性小鼠在衰老过程中与抗氧化反应等相关基因表达增加,而 Park7 雄性小鼠中未出现。
  • DJ - 1 - NRF2 - CYP1B1 轴调节小鼠星形胶质细胞中 Cdh1 的表达:在雄性中高表达且在 Park7 小鼠中显著降低的基因中,Cyp1b1 编码参与雌激素和维甲酸代谢的细胞色素 P450 家族酶。RNA - seq、RT - qPCR 和 RNAscope 分析表明,Cyp1b1 在雄性中脑下调,且主要在星形胶质细胞中表达。在原代星形胶质细胞中进行 RNAi 实验,发现敲低 Park7、Nfe2l2 或 Cyp1b1 会导致雄性星形胶质细胞中 Cdh1 下调,表明 EMT 通路改变可能发生在星形胶质细胞中,且涉及 NRF2 - CYP1B1 轴。
  • Park7 缺失诱导的粘着斑和上皮 - 间质转化变化涉及星形胶质细胞中的 NRF2 和 CYP1B1:对雄性原代星形胶质细胞进行转录组分析,发现敲低 Park7、Nfe2l2 和 Cyp1b1 会诱导大量基因差异表达,且下调基因在粘着斑和 EMT 等通路显著富集。在携带 PARK7 突变的人类 iPSC 衍生的星形胶质细胞中,也观察到类似的 EMT 通路富集,表明这些发现可能与人类 PD 的诊断和疾病进展相关。

研究结论和讨论部分指出,该研究揭示了 Park7 缺失导致的性别特异性转录组变化,涉及中脑星形胶质细胞中 NRF2 和 CYP1B1 对 EMT、ECM 和粘着斑相关基因的调节。这些结果为探究 PD 进展机制及其性别差异开辟了新途径。一方面,有助于解释为什么男性 PD 患病率更高,可能与 DJ - 1 缺失后男性中脑的这些变化更易导致氧化应激和神经损伤有关。另一方面,为开发针对 PD 的个性化治疗策略提供了理论依据,未来或许可以针对 NRF2 - CYP1B1 轴等关键靶点进行药物研发,以改善 PD 患者的病情。总之,该研究成果对于深入理解 PD 的发病机制和临床治疗具有重要意义。

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