非小细胞肺癌可变剪接的全球分析:揭示组织学和人群差异的新奥秘
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时间:2025年01月23日
来源:Oncogene 6.9
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肺癌在美国高发,非裔美国男性患病风险更高。研究人员对腺癌(LUAD)和鳞状细胞癌(LUSC)患者的肿瘤及癌旁组织进行 RNA 测序,识别出肿瘤与癌旁组织间的可变剪接(AS)生物标志物,或助于理解肺癌分子亚型,推动健康公平。
肺癌是美国最常被诊断出的癌症之一。非裔美国(AA)男性比欧裔美国(EA)男性更易患肺癌,且发病率和死亡率更高。在此,研究人员对两个独立队列的腺癌(LUAD)和鳞状细胞癌(LUSC)患者的肺肿瘤及癌旁组织(NATs)进行高通量、高深度的总 RNA 测序,报告了可信度高的可变剪接(AS)事件。研究识别出在 AA 和 EA 人群中,肺肿瘤与 NATs 之间具有显著差异剪接百分比(PSI)值的新型 AS 生物标志物,这些生物标志物与致癌信号通路相关。研究还发现了与细胞表面蛋白和癌症驱动基因相关的肿瘤亚型特异性和人群特异性的 AS 事件。研究强调了两个群体中 LUAD 特有的 SYNE2 基因的显著 AS 事件,以及 EA 人群中 LUAD 特异性的 CD44 基因和 AA 人群中 LUAD 特异性的 TMBIM6 基因的 AS 事件。此外,研究还展示了基于直接高通量逆转录 PCR 对癌症特征的验证。这项大规模的肺肿瘤研究提供了丰富的数据资源,有助于理解 AA 和 EA 人群肺肿瘤的分子亚型,揭示新的治疗靶点,从而可能推动健康公平。
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