Multiomics approach identifies dysregulated lipidomic and proteomic networks in Parkinson’s disease patients mutated in TMEM175:帕金森病研究的新突破

【字体: 时间:2025年01月26日 来源:npj Parkinson's Disease 6.7

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  帕金森病(PD)临床可用的生物标志物有待确定和验证。研究人员采用非靶向组学方法,对携带 TMEM175 基因突变的 PD 患者进行研究。结果揭示了多种代谢途径改变,发现多种脂质和蛋白的变化与疾病相关。这为 PD 的预测、诊断和治疗提供了新见解。

  帕金森病(Parkinson’s disease,PD)是一种常见的神经退行性疾病,其病理生理学机制复杂,目前临床诊断主要依赖临床症状和对多巴胺能药物的反应,早期诊断容易误诊。而且,虽然在 PD 生物标志物研究方面取得了一些进展,但临床上有用的生化标志物仍有待发现和验证,以实现更早期、精确的诊断和亚型区分,这对于制定个性化治疗方案至关重要。此外,还需要生物标志物来预测疾病进程和监测治疗效果。因此,深入研究 PD 的分子机制和寻找有效的生物标志物迫在眉睫。
意大利国家研究委员会(Institute of Genetics and Biophysics “Adriano Buzzati - Traverso”)等机构的研究人员开展了相关研究,旨在探究携带 TMEM175 基因突变的 PD 患者的脂质组、代谢组和蛋白质组特征,寻找新的代谢途径改变和潜在生物标志物。研究发现,携带 TMEM175 基因突变的 PD 患者在脂质代谢、氨基酸代谢等多条途径存在显著异常,多种脂质和代谢物水平与疾病的发病年龄、症状严重程度相关。这一研究为 PD 的预测、诊断和治疗提供了新的方向和潜在靶点,对推动 PD 的精准医学发展具有重要意义。该研究成果发表在《npj Parkinson's Disease》杂志上。

研究人员用到的主要关键技术方法包括:对 804 名 PD 患者和 282 名健康受试者进行全外显子测序(WES);利用液相色谱 - 高分辨率质谱技术分析血浆和皮肤成纤维细胞的脂质组;运用代谢组学方法检测血浆中代谢物;通过蛋白质组学技术分析皮肤成纤维细胞中的蛋白质;采用多种统计分析方法和生物信息学工具探究组学数据间的关系。

研究结果如下:

  • 分析血浆样本:对血浆样本进行脂质组学分析,发现携带 TMEM175 基因突变的 PD 患者血浆脂质组谱有特异性改变,多种脂质类别的表达发生变化,如脂肪酸(FA)、甘油磷脂和鞘磷脂等显著增加,胆固醇酯(CEs)显著下调。代谢组学分析显示,患者血浆中氨基酸代谢途径改变,尤其是色氨酸、组氨酸和 β - 丙氨酸代谢以及赖氨酸降解途径受影响。相关性分析表明,血浆中磷脂酰胆碱(PC)和磷脂酰肌醇(PI)34:1 水平与发病年龄呈负相关,L - 谷氨酸水平与运动和非运动症状严重程度呈正相关。
  • 分析患者来源的皮肤成纤维细胞:对皮肤成纤维细胞进行脂质组学分析,发现 PD 患者细胞中脂质物种存在广泛失调,如酰基肉碱(CAR)、己糖神经酰胺(HexCer)等在携带 TMEM175 基因突变的患者细胞中增加,神经酰胺(Cer)、PC 等减少。蛋白质组学分析显示,患者细胞中溶酶体、线粒体和细胞外基质相关蛋白存在高度失调,参与脂质生物合成、胰岛素途径、线粒体代谢和自噬的蛋白质表达改变。整合相关性分析发现,蛋白质组和脂质组之间存在高度相关性,确定了与 PC、Cer 等脂质相关的蛋白质簇,这些蛋白质参与多种代谢途径。

研究结论和讨论部分指出,该研究首次采用非靶向组学方法揭示了携带 TMEM175 基因突变的 PD 患者的潜在分子改变。研究发现的脂质和蛋白质变化与疾病的相关性,为 PD 的发病机制提供了新的见解。不过,该研究存在样本量较小、缺乏血浆蛋白质组分析等局限性。但总体而言,这些结果为未来研究奠定了基础,支持对患者进行分层研究有助于发现细微差异的观点,对 PD 的研究和治疗具有重要的推动作用。

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