最长片段可达 200 kbp!看 ta 如何 2 小时完成 DNA 抽提?

【字体: 时间:2025年01月13日 来源:基因有限公司

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  NucleoBond® 重力流程序将剪切力降至最低,从而保持 DNA 的高度完整性。此外,阴离子交换技术能够实现高纯度和抑制剂去除。

目前三代测序常用的核酸纯化方法有酚-氯仿提取法、盐析法、核分离-琼脂糖包埋法,以及通过使用硅胶膜试剂盒和磁珠法来进行 DNA 提取,但以上这些方法都有比较明显的缺点。

1. 酚-氯仿提取法:萃取物含有有毒试剂,需要特殊的废物处理。

2. 盐析法:由于缺少柱膜纯化,提取的 DNA 往往有大量的污染物和抑制剂组份,盐析过程冗长且耗时。

3. 核分离-琼脂糖包埋法:对操作的要求比较高,且过程繁琐,大约需要 1-2 天的时间来完成大片段的制备。

4. 硅胶膜试剂盒和磁珠法:离心力(硅胶膜提取方法)和频繁的吸液与混合(磁珠法)会对 DNA 产生显著的剪切作用。因此,硅胶膜和磁珠法纯化得到的 DNA 很少超过 30 kbp,并且含有单链缺口,降低了HMW 应用。

还有一种基于阴离子交换色谱法的核酸纯化方法:

NucleoBond® HMW DNA 纯化试剂盒

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片段长,最长可达 200 kbp: 

裂解液重力过柱,无需离心,减少了离心力对核酸的破碎作用,尽量保证核酸原生态,最长片段可达 200 kbp。

纯度高:

采用了阴离子交换色谱技术,对核酸下游应用有抑制作用的组分均被清除,核酸纯度较高。

样本类型广:

相比以往的核酸抽提产品,这款试剂盒可以覆盖大多数样本类型,并且支持更大的上样量,比如 1.5 g 植物组织、300 mg 微生物样本(革兰氏阴性/阳性菌、酵母菌)、300 mg 动物组织、2 ml 血液/体液、107个细胞(酶裂解法)等。

速度快:

包括 30 min 的裂解时间在内,整个提取过程 2 h。

NucleoBond® 重力流程序将剪切力降至最低,从而保持 DNA 的高度完整性。

此外,阴离子交换技术能够实现高纯度和抑制剂去除。这使得 NucleoBond® HMW DNA 纯化试剂盒成为常用的 long-read 测序技术(如 SMRT 和 Nanopore)以及 long-range short-read 测序方法(如 Next GEM(10× Genomics))的理想选择。

——   操作流程  ——

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对于较难提取的样本,这款试剂盒兼容 NucleoSpin® Bead Tubes,可以使样本进行更充分匀浆,同时还兼容裂解前各种商业化酶。

如果对 DNA 完整性要求较高,可以使用异丙醇沉淀 DNA 的方法提取,也可以使用 NucleoSnap® Finishers 或 NucleoSpin® Finishers使 DNA 更快地脱盐和浓缩。

一起来看 NucleoBond® HMW DNA 纯化试剂盒的出色表现!

「  大片段DNA!」

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通过机械裂解从某植物样本中纯化得到的 DNA 大片段后,在 Femto Pulse 系统可检测到高达 200 kbp 的片段,在117218 bp检测到主峰,证明了 NucleoBond® HMW DNA 纯化试剂盒提取和纯化高分子量 DNA 的能力。

客户测试结果:

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DNA 来自植物样本黄褐棉,使用 NucleoBond® HMW DNA 试剂盒进行核酸纯化。如图所示,在 164251 bp检测到主峰,最长片段可达 200 kbp。

「 更长的subread!」

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通过酶裂解的方式从 HeLa 细胞中纯化 DNA ,并在 PacBio RS Ⅱ上进行 SMRT 测序分析,与Q品牌的两款常用产品 (试剂盒P 和试剂盒M)相比,可以看出NucleoBond® HMW DNA 试剂盒(MN)可以得到更高的 subread 平均长度,从而实现更好的测序结果。

「 适用不同的样本类型,且得率和纯度较高!」

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除了 DNA 的完整性,纯度和得率对于 HMW DNA 测序结果的影响也很重要。使用 NucleoBond® HMW DNA 试剂盒提取不同的样本,得率可以满足后续测序试验,吸光度比值 A260/A230 >2.00 和 A260/A280 >1.75,表明样本纯度很高。

客户测试结果:

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DNA 来自植物样本黄褐棉,使用 NucleoBond® HMW DNA 试剂盒进行核酸纯化。

——  产品信息  ——

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基因有限公司作为德国 MN 品牌全国一级代理商,可为您提供针对不同类型样本的核酸抽提解决方案!

欢迎添加产品专员

了解更多产品信息!

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