对Pediococcus damnosus NIB 608基因组进行比较分析，以识别与啤酒中的压力反应和变质相关的基因

《FOOD SCIENCE AND BIOTECHNOLOGY》：Comparative analysis of the Pediococcus damnosus NIB 608 genome to identify genes related to stress and spoilage in beer

啤酒变质菌Pediococcus damnosus NIB 608基因组含1环状染色体和3质粒，比较分析显示horA/horC基因簇在多个菌株中存在，与啤酒花抗性和细胞膜结构相关。该菌株缺乏fabZ基因但利用啤酒中游离脂肪酸存活，表明其代谢依赖环境因素，基因组特征与啤酒变质潜力评估需结合环境条件。

　　

摘要

Pediococcus damnosus NIB 608是从变质的啤酒中分离出来的，对其基因组进行了分析以识别与压力和腐败相关的基因。完整的基因组测序显示该菌含有一个环状染色体以及三个质粒。对六个P. damnosus菌株的比较基因组分析表明，horA和horC基因簇存在于多个菌株中，这些由质粒编码的基因簇在抗啤酒花能力和维持细胞膜结构方面发挥作用。Pediococcus damnosus NIB 608携带多种糖基转移酶基因，其中许多基因与胞外多糖的产生和膜相关糖链的合成有关。值得注意的是，脂肪酸生物合成基因fabZ缺失，这代表了一种代谢限制。然而，由于啤酒中存在外源性脂肪酸，该菌株仍能够作为导致啤酒腐败的微生物存活。这些发现表明P. damnosus菌株具有既共通又多样的遗传特征，强调了在评估其腐败潜力时需要同时考虑基因组特征和环境条件的重要性。