整合转录组学与机器学习预测胃癌铁死亡相关基因并揭示GOT1的调控作用

本综述通过整合转录组学（WGCNA）与机器学习（SVM/RF）技术，筛选出胃癌（GC）中铁死亡（Ferroptosis）关键基因GOT1。实验验证表明GOT1通过调控活性氧（ROS）和Fe2+水平抑制胃癌细胞增殖、迁移并诱导铁死亡，为胃癌靶向治疗提供新策略。

　　

Highlight

Identification of differentially expressed genes in GC

利用生物信息学平台Sangerbox对GSE184336数据集分析显示，胃癌组织与癌旁组织存在2297个差异表达基因，其中1316个上调、981个下调（筛选标准：P<0.05且|log₂FC|≥1）。火山图（图1A）展示了表达差异最显著的前20个上调与下调基因。

Discussion

胃癌（GC）因早期症状隐匿常确诊于中晚期，此时癌细胞可能已发生局部侵袭或远端转移，错失最佳治疗时机。当前临床主要依赖手术切除、化疗及生物疗法，但效果有限。本研究通过多组学手段揭示GOT1调控铁死亡的作用机制，为开发新型治疗策略提供理论依据。

Ethics approval and consent to participate

本研究经厦门大学成功医院伦理委员会审批通过，所有参与者均签署书面知情同意书。

Funding

本研究未获得任何资金支持。

CRediT authorship contribution statement

吴晓玲（Xiao-Ling Wu）：负责综述撰写、可视化、验证、监督、项目管理、方法论设计及概念化；陈章兴（Zhang-Xing Chen）：负责可视化、验证、软件、资源、数据整理与形式化分析；李培（Pei Li）：参与综述撰写、验证、资源整合与数据分析；林珊蒂（Shan-Ti Lin）等其余作者分别承担原始草案撰写、实验操作、资源提供与 Formal analysis 等工作。

Declaration of Competing Interest

作者声明不存在任何可能影响本研究结果的财务或非财务利益冲突。

Acknowledgment

无致谢内容。

Consent for publication

所有患者均同意参与本研究并发表相关数据。

Disclosure of interest

作者确认不存在任何利益冲突。