面向胃肠道间质瘤的自动化有丝分裂检测:一种可解释机器学习框架及其临床转化价值

【字体: 时间:2025年10月01日 来源:Pathology - Research and Practice 2.9

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  本文提出了一种针对胃肠道间质瘤(GIST)有丝分裂自动检测的可解释机器学习框架。研究通过双尺度级联策略(10×初筛ROI与40×精准检测)显著提升检测效能(F1值达0.89),并证实自动计数与Ki-67表达呈强相关性(r=0.6187)。SHAP可解释性分析揭示模型决策逻辑与病理诊断标准(如核膜解体、染色质凝集)高度吻合,为传统机器学习在精准病理诊断中的应用提供了新范式。

  
Highlight
胃肠道间质瘤(GIST)作为最常见的胃肠道 submucosal 肿瘤,其恶性潜能评估高度依赖于有丝分裂指数(mitotic index)。传统显微镜计数存在劳动强度大与观察者间差异性的双重挑战,而现有模型难以适配GIST特有的梭形细胞形态。本研究首次构建针对GIST的机器学习自动检测框架,通过13,965个有丝分裂细胞标注数据集与六种算法对比,证实径向基支持向量机(SVM-RBF)在双放大倍数下均表现最优(10×: F1=0.83; 40×: F1=0.89)。
Method
研究采用仿临床实践的双阶段级联策略:首先通过10×模型快速定位感兴趣区域(ROIs),再利用40×模型实现精准检测与计数。该流程整合了细胞核分割、特征提取与特征选择模块,确保模型决策逻辑与病理学家诊断标准的一致性。
Patient Demographics and Pathological Characteristics
基于317例患者的383张H&E染色切片,研究纳入133张切片用于模型开发(其中90%为梭形细胞形态),剩余250张用于验证。绝大多数肿瘤有丝分裂指数低于5/50HPF,而人工筛选增加了中高风险GIST的占比以增强模型泛化能力。
Discussion
本研究突破性地解决了GIST组织切片中梭形细胞形态与有丝分裂稀少带来的检测难题。模型在细胞层级的高性能(F1>0.83)凸显其在数据标注、特征选择与临床适配方面的独特优势。通过建立首个GIST特化有丝分裂数据库与可解释分析框架,为传统机器学习在精准病理应用中的价值提供了有力证据。
Author contributions
董欣:研究构思与论文撰写;董佳强:算法开发与优化;牛敏:病理切片与数据收集;王月:数据标注辅助;缪立文:图像处理与特征提取;刘凯/折逸通:病理图像审阅;刘治国/韩莹:论文修订与研究指导。
Disclosures
所有作者声明无利益冲突。
Funding
本研究受国家重点研发计划(2023YFC2507403)与陕西省重点研发计划(2023-ZDLSF-36)资助。
CRediT authorship contribution statement
董欣:原创撰写/验证/软件/方法论;刘凯:资源/数据整理;董佳强:可视化/验证/软件;王月:形式分析/数据整理;牛敏:形式分析;折逸通:资源/数据整理;缪立文:形式分析/数据整理;刘治国:论文修订/监督/基金获取;韩莹:研究监督/方法论。
Declaration of Competing Interest
作者声明不存在可能影响研究结果的竞争性利益关系。
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