ORMDL1作为食管鳞癌新型预后标志物及免疫治疗靶点的多组学与功能研究
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时间:2025年10月01日
来源:Translational Oncology 4.1
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本研究针对食管鳞癌(ESCC)缺乏有效预后标志物的问题,通过生物信息学分析、Western blot和免疫组化等技术,首次发现ORMDL1在ESCC中显著高表达且与不良预后相关。研究证实ORMDL1通过调控肿瘤免疫微环境促进疾病进展,为ESCC的预后评估和靶向治疗提供了新的分子标志物和干预靶点。
食管癌是全球第七大常见恶性肿瘤,每年新增病例超过47万例,其中食管鳞状细胞癌(ESCC)占主导地位。尽管在诊断和治疗方面取得了进展,但ESCC患者的5年生存率仍然徘徊在15%-20%之间,这主要是由于晚期诊断、治疗选择有限以及治疗耐药性所致。当前生物标志物如HER-2和PD-L1在预测患者结局和指导个体化治疗方面仍存在局限性,因此开发新的生物标志物对于ESCC的早期检测、预后评估和治疗决策至关重要。
在这项发表于《Translational Oncology》的研究中,研究人员聚焦于ORMDL1基因——内质网膜蛋白ORMDL家族成员,其在多种人类癌症中的异常表达近年来备受关注。为了探索ORMDL1在ESCC中的潜在作用,研究团队整合了多组学数据与临床样本实验验证,旨在阐明其作为ESCC诊断和预后生物标志物的潜力。
研究采用的主要技术方法包括:利用TCGA和GEO数据库进行生物信息学分析;通过Western blot和免疫组化验证ORMDL1蛋白表达;使用CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润;采用CCK-8、Transwell和伤口愈合实验评估细胞功能;基于100例ESCC患者队列进行临床病理关联分析和生存分析。
研究人员通过Gene Cards数据库分析发现,ORMDL1基因位于染色体2q32.2区域,其编码蛋白主要定位于内质网膜(置信度5),次要分布于质膜和细胞质。这表明ORMDL1可能通过内质网相关功能参与细胞生理过程。
生物信息学数据显示ORMDL1在食管肿瘤样本和癌细胞中强表达
TCGA数据分析显示ORMDL1在食管癌组织中显著上调(p<0.001)。泛癌分析进一步表明其在多种癌症类型中广泛上调,其中ESCC差异最显著(ΔLog2(TPM)=1.86)。空间可视化模型(雷达图)证实肿瘤组织中ORMDL1表达明显更高,特别是在食管癌、胶质母细胞瘤和头颈鳞状细胞癌中。GSEA分析显示ORMDL1高表达显著激活细胞外基质通路(如NABA Core Matrisome,NES=3.52),同时抑制上皮角质化过程(如Keratinization,NES=-2.83)。GO/KEGG分析表明ORMDL1导致表皮发育相关基因集显著下调(Z-score<-4),同时激活IL-17等炎症通路。
通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,发现ORMDL1与SPTLC1(0.972)、SPTLC2(0.953)、SPTLC3(0.953)等蛋白存在强相互作用。免疫浸润分析显示ORMDL1表达与多种免疫细胞亚型显著相关,其中与T辅助细胞(R=0.354)呈正相关,与中性粒细胞(R=-0.231)呈负相关。堆叠条形图显示高表达组中浆细胞等免疫细胞比例增加,提示活跃的适应性免疫反应。
Western blot和免疫组化分析显示ORMDL1在食管鳞癌细胞系和肿瘤组织中强表达
实验验证显示多个ESCC细胞系(KYSE30、KYSE150、KYSE410、KYSE510、TE-1)中ORMDL1表达显著高于正常人食管上皮细胞(HET-1A)。免疫荧光成像证实ORMDL1主要定位于内质网膜。免疫组化分析显示肿瘤组织中ORMDL1表达升高,Western blot分析7对匹配的ESCC和癌旁组织进一步证实了这一发现。
ORMDL1过表达显著影响食管鳞状细胞癌细胞的增殖和侵袭行为
功能实验表明,过表达ORMDL1显著促进KYSE30细胞增殖(P<0.05)。Transwell实验显示过表达组穿过基质胶和Transwell膜的细胞数量显著增加,迁移和侵袭率明显高于对照组(P<0.05)。伤口愈合实验显示OE-ORMDL1组伤口闭合更快,细胞迁移率显著增强(P<0.05),在TE-1细胞中也观察到类似现象。
ROC曲线分析显示曲线下面积(AUC)为0.805(95%CI:0.685-0.925),表明ORMDL1能较好区分癌与正常食管组织。基于TCGA数据的Kaplan-Meier生存曲线显示高表达患者总生存期显著缩短(HR=2.76,95%CI:1.10-6.94,P=0.030)。100例患者队列验证再次证实高表达组预后较差(P<0.001)。研究人员还构建了包含ORMDL1表达、TNM分期等参数的预后列线图,用于预测1年、3年和5年生存率。
临床病理参数分析显示ORMDL1高表达与T分期升高(P=0.040)、淋巴结转移(P=0.015)、TNM分期更高(P<0.001)和组织学分化更低(P<0.001)显著相关。单因素Cox分析显示高ORMDL1表达与不良生存结局显著相关(HR=2.918,95%CI:1.701-5.006,P<0.001)。多因素分析中TNM分期(HR=5.888,95%CI:1.696-20.439,P<0.005)被确定为独立预后因素。
研究讨论部分指出,ORMDL蛋白家族(包括ORMDL1、ORMDL2和ORMDL3)是一类进化上保守的 transmembrane 蛋白,最初在酵母中鉴定为Orm1/Orm2,主要通过调节细胞内鞘脂代谢稳态发挥作用。在哺乳动物中,这三个高度同源的蛋白都定位于内质网膜,具有典型的四 transmembrane 结构,其N末端面向细胞质侧,C末端位于内质网腔内。
ORMDL1可能通过调节脂质代谢途径、内质网应激反应及其与其它细胞内机制的相互作用来影响癌细胞的增殖、迁移和侵袭特性。通过调控SPTLC1活性和鞘脂代谢,ORMDL1可能成为癌症治疗的一个潜在干预点,特别是在影响肿瘤细胞生存和癌症进展方面。
肿瘤微环境(TME)在癌症发生、发展和转移中起着至关重要的作用,它支持肿瘤细胞生长并通过多种机制帮助癌细胞逃避免疫系统、侵袭组织和转移。研究表明ORMDL1表达与ESCC组织中多种免疫细胞存在强正相关,提示ORMDL1可能有助于调节肿瘤免疫环境并参与ESCC的免疫控制。
研究结论表明,ORMDL1在ESCC组织中表达显著增加,且高水平ORMDL1与ESCC患者总生存期缩短密切相关,表明其可能作为该恶性肿瘤的不良预后生物标志物。通过TCGA和临床样本分析,进一步证实了ORMDL1在ESCC中的潜在作用,其与肿瘤发生和进展密切相关,并可能通过调节免疫微环境影响肿瘤免疫逃逸和转移。该研究为使用ORMDL1作为食管鳞状细胞癌的诊断和预后生物标志物奠定了坚实基础,并为未来针对ORMDL1及其在肿瘤免疫微环境中作用的靶向治疗提供了重要的研究途径。
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