基于代谢组学的肺鳞癌诊断模型构建:精氨酸、C18:2及PC.ae.C38.0的关键作用
《Scientific Reports》:Metabolic profiles of squamous cell lung carcinoma and diagnostic model construction
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年10月02日
来源:Scientific Reports 3.9
编辑推荐:
本研究针对肺鳞癌(LUSC)诊断手段有限的问题,通过代谢组学分析发现精氨酸(Arg)水平升高、酰基肉碱C18:2和磷脂酰胆碱PC.ae.C38.0降低与LUSC诊断及预后显著相关。研究人员利用机器学习算法筛选关键代谢物,构建诊断模型,并通过网络分析揭示LPC介导的代谢重编程机制。该研究为LUSC提供了潜在的血液生物标志物,对早期诊断和预后评估具有重要意义。
肺癌是全球死亡率最高的恶性肿瘤,其中肺鳞癌(LUSC)占非小细胞肺癌的30%,由于靶向治疗选择有限,患者预后较差。癌细胞通过代谢重编程满足其快速增殖的需求,代谢组学为揭示癌症发生机制提供了新视角。然而,LUSC的特异性代谢特征及其临床价值尚不明确。
本研究采用靶向代谢组学技术,通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)分析了98例健康对照和73例LUSC患者血浆样本中的188种代谢物。研究人员使用多种机器学习算法(包括LASSO、随机森林等)进行特征筛选,并通过网络分析探索代谢物间的相互作用关系。此外,结合TCGA公共数据库的RNA-seq数据验证代谢相关基因的预后价值。
比较LUSC患者与健康对照发现,123种代谢物存在显著差异。LUSC组精氨酸(Arg)和血清素水平升高,而酰基肉碱C18:2、C10:1等显著降低。早期与晚期LUSC对比显示,谷氨酸、苯丙氨酸及部分磷脂酰胆碱(PC)分子(如PC.aa.C34.4、PC.aa.C36.2)浓度随疾病进展发生变化。
七种算法一致筛选出Arg、C18:2、PC.ae.C38.0等关键代谢物。LASSO回归进一步验证了Arg、C18.2、PC.ae.C38.0、PC.aa.C38.6和血清素的诊断价值。其中,Arg、C18.2和PC.ae.C38.0组成的诊断模型曲线下面积(AUROC)分别达0.911、0.997和0.858。
健康对照组代谢网络密度、异质性和平均度均高于LUSC组,而LUSC组模块性更强。LPC在LUSC中介导了氨基酸与PC亚群间的相互作用,晚期患者中氨基酸与LPC形成孤立模块,提示代谢通路协调性破坏。
TCGA数据分析显示,Arg代谢途径相关基因(ASL、OTC、PYCR2)及PC/LPC代谢基因(CEPT1、LPCAT1、PLA2G16等)表达与患者5年生存率显著相关,多变量分析证实ASL和LPCAT1为独立预后因素。
本研究首次系统揭示了LUSC患者血浆代谢谱特征,提出Arg、C18.2和PC.ae.C38.0作为潜在诊断标志物。网络分析表明LPC在代谢重编程中发挥桥梁作用,为理解LUSC发病机制提供了新视角。尽管样本量存在局限,但结合公共数据库的验证增强了结论的可靠性。该研究成果发表于《Scientific Reports》,为LUSC的早期诊断和代谢靶向治疗奠定了理论基础。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号