人源ADAR功能缺失突变通过激活先天免疫反应促进肠道炎症的机制研究
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时间:2025年10月02日
来源:Nature Communications 15.7
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本研究揭示了RNA编辑酶ADAR功能缺失(如p.N173S突变)通过导致双链RNA(dsRNA)和内源性逆转录病毒(ERVs)积累,激活MDA5介导的dsRNA感知和JAK-STAT信号通路,从而驱动炎症性肠病(IBD)发生。研究人员通过基因敲除小鼠、类器官模型和人类队列分析,证实ADAR-dsRNA/ERVs-MDA5-JAK/STAT轴是IBD的潜在治疗靶点,JAK1/2抑制剂鲁索替尼可显著缓解肠道炎症。
炎症性肠病(IBD)是一种慢性肠道炎症性疾病,包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC),全球患者数量超过600万,且发病率持续上升。IBD的发病机制复杂,涉及遗传因素与环境因素的相互作用。尽管全基因组关联研究(GWAS)已发现多个IBD相关基因,如NOD2、IL23R等,但具体的分子机制尚未完全阐明。近年来,RNA编辑尤其是腺苷脱氨酶作用于RNA(ADAR)介导的A-to-I编辑,在维持组织稳态和抑制先天免疫反应中的作用备受关注。ADAR功能缺失突变与自身免疫性疾病如Aicardi-Goutieres综合征(AGS)相关,但其在IBD中的作用仍不清楚。
本研究通过整合人类遗传学数据分析、基因工程小鼠模型、肠道类器官培养和多组学技术,系统揭示了ADAR在肠道炎症中的关键作用。研究人员首先分析了人类基因组数据库(gnomAD)和欧洲IBD队列,发现ADAR基因的错义突变p.Asn173Ser(N173S)在IBD患者中显著富集。该突变位于ADAR的Zα结构域,可能影响其与Z-RNA的结合能力。通过体外细胞实验证实,ADARN173S突变体完全丧失了A-to-I编辑活性,无法挽救ADAR敲低导致的GLI1基因编辑缺陷。
在机制探索方面,研究人员构建了肠道上皮细胞特异性Adar敲除小鼠(AdariΔgut)。诱导敲除后,小鼠出现自发性回肠炎和结肠炎,表现为肠道缩短、体重下降、上皮损伤和炎症因子分泌增加。转录组分析显示,Adar缺失导致干扰素信号通路(特别是I型和II型干扰素反应)和JAK-STAT通路显著激活。进一步研究发现,Adar缺失导致双链RNA(dsRNA)和内源性逆转录病毒(ERVs)积累,激活MDA5介导的dsRNA感知通路。通过构建Mda5敲除的AdariΔgut小鼠(AdariΔgutMda5-/-),证实MDA5是Adar缺失诱导肠道炎症的关键介质。
RNA编辑组分析鉴定了Mda5作为ADAR的直接编辑靶点。Mda5第480位异亮氨酸(Ile)到缬氨酸(Val)的编辑(I480V)显著降低了MDA5的dsRNA感知活性和蛋白稳定性。在类器官模型中,过表达编辑形式Mda5I480V可部分挽救Adar缺失导致的细胞死亡。此外,JAK1/2抑制剂鲁索替尼(Ruxolitinib)可有效缓解Adar缺失小鼠的肠道炎症和类器官死亡,而其他JAK抑制剂(如托法替尼)效果有限。
临床相关性方面,人类IBD患者肠道活检显示ADAR表达降低,且ERVs表达上调。通过腺相关病毒(AAV8)介导的肠道特异性表达,证实人源ADARN173S突变体无法挽救Adar敲除小鼠的IBD表型,进一步验证了该突变的功能缺失特性。
主要技术方法包括:①利用肠道类器官模型进行基因编辑和药物筛选;②单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析人类和小鼠肠道细胞ADAR表达谱;③RNA编辑组测序(editome sequencing)鉴定ADAR依赖的编辑位点;④炎症因子抗体芯片检测血清细胞因子水平;⑤AAV8介导的肠道特异性基因表达;⑥人源化小鼠模型验证ADAR突变功能。
Identification of ADARN173S as a loss function mutation that correlates with IBD incidence in patients
通过人群遗传学分析发现ADAR p.N173S突变在芬兰IBD队列中显著富集(携带率约1/126)。该突变导致ADAR蛋白编辑功能丧失,且无法挽救ADAR敲低细胞的RNA编辑缺陷。
The expression of ADAR is specifically decreased in the gut epithelium of IBD patients and mice
免疫组化显示IBD患者和小鼠肠道隐窝中ADAR表达显著降低,而上皮细胞是ADAR表达的主要细胞类型。
Intestinal epithelial- or stem cell-specific ablation of ADAR triggers spontaneous bowel inflammation and compromises intestinal organoid growth
肠道特异性Adar敲除小鼠出现自发性肠道炎症、上皮细胞凋亡和肠道类器官死亡。转录组分析显示干扰素通路和JAK-STAT通路激活。
ADAR regulates the sensing of self and non-self RNA, and loss-of-function of ADAR can cause AGS
Adar缺失导致内源性逆转录病毒(ERVs)积累和dsRNA形成,激活先天免疫反应。
MDA5-mediated dsRNA sensing is required for intestinal Adar deficiency-induced bowel inflammation and organoid death
Mda5敲除完全挽救Adar缺失导致的肠道炎症和类器官死亡,证实MDA5是核心效应分子。
Mda5 is a target of Adar-mediated RNA editing, which decreases its dsRNA sensing activity
RNA编辑组分析鉴定Mda5为ADAR直接编辑靶点,编辑形式Mda5I480V具有更低的dsRNA感知活性。
Ruxolitinib attenuates Adar deficiency-induced organoid death and bowel inflammation
JAK1/2抑制剂鲁索替尼有效缓解Adar缺失导致的肠道炎症,而其他JAK抑制剂效果不佳。
Characterization of ADARN173S as a loss function mutation that may have triggered bowel inflammation in patients and mice
人源ADARN173S突变体无法挽救Adar敲除小鼠的IBD表型,证实其功能缺失特性。
本研究首次揭示ADAR功能缺失通过dsRNA/ERVs-MDA5-JAK/STAT轴驱动肠道炎症的机制。ADAR p.N173S突变作为功能缺失变异,与IBD发病风险显著相关。研究发现JAK1/2双重抑制剂鲁索替尼对ADAR缺失相关炎症具有显著治疗效果,为IBD的精准治疗提供了新策略。该研究不仅阐明了RNA编辑在肠道免疫稳态中的关键作用,还为开发针对ADAR-MDA5通路的治疗方法奠定了理论基础。
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