协同演化研究: 协同系统发育分析方法与进展

　　摘要： 协同演化是推动和维持地球生物多样性的重要驱动力, 其产生的演化结果与关系模式对于揭示生物多样性的产生和维持机制十分关键。协同系统发育分析作为推断物种间相互作用或相互作用网络协同演化过程所产生结果模式的重要方法, 可以建立在两个或多个类群的系统发育树之间, 通过全局拟合或基于事件的分析方法, 推断类群间的系统发育一致性及协同宏演化事件。本文首先介绍了协同演化的基本概念。其次, 系统阐述了协同系统发育分析在两个类群和多个类群之间的常用分析方法, 并对全局拟合和基于事件分析的两大类方法进行了比较。随后, 综述了协同系统发育分析方法在物种间相互作用及群落构建的协同演化研究中的应用。最后, 本文综合该领域中现有的研究方法和进展, 探讨了当前方法的局限性, 并对协同系统发育分析方法在协同演化中的研究发展方向提出了展望。