基于GenBank数据库的真核生物遗传数据时空格局分析
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年10月01日
来源:《生物多样性》
编辑推荐:
摘要: 遗传数据在生物多样性研究和保护实践中发挥着越来越重要的作用, 然而研究者应用这些数据时常面临数据质量缺陷、地理或类群分布不均等方面的制约, 尽管陆生脊椎动物的遗传数据格局已有较深入研究, 但全球植物、真菌和其他动物类群的遗传数据空间分布模式仍缺乏系统的实证研究
摘要: 遗传数据在生物多样性研究和保护实践中发挥着越来越重要的作用, 然而研究者应用这些数据时常面临数据质量缺陷、地理或类群分布不均等方面的制约, 尽管陆生脊椎动物的遗传数据格局已有较深入研究, 但全球植物、真菌和其他动物类群的遗传数据空间分布模式仍缺乏系统的实证研究。本文采用多尺度分析方法, 系统评估了动物、植物和真菌三大真核生物界的遗传数据现状、元数据完整性以及遗传数据的时空动态趋势。结果表明, 动物界拥有约2.7亿条序列和1.6万个基因组数据, 超过植物界(约1.4亿条, 0.7万个)和真菌界(约0.2亿条, 1.7万个)。遗传数据的地理元数据缺失现象普遍存在, 其中真菌ITS序列的经纬度缺失最为严重(缺失率92.07%), 其次是植物rbcL (83.19%)和动物COI (26.40%)。时空分布格局显示, 全球尺度上遗传数据呈现明显的“北半球中心化”特征, 北美、西欧和东亚地区占据主导地位, 而南半球普遍数据匮乏; 同时观察到动物COI和植物rbcL数据呈下降趋势, 而真菌ITS数据快速增长。中国区域则表现出独特的“南动物、东植物、北真菌”分布格局, 而西北地区数据积累明显不足; 时间维度上, 中国植物和真菌数据持续增长, 而动物数据保持稳定。这些发现揭示了遗传数据质量缺陷和分布失衡已成为制约生物多样性研究的重要瓶颈。为此, 我们建议建立严格的元数据存档标准, 重点加强南半球和中国西北部等数据薄弱区域的科研投入, 并通过构建国际科研合作网络促进全球数据资源的均衡配置, 从而提升遗传数据在生物多样性研究和保护实践中的应用价值。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号