
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
解读两种氟化2′-羟基查尔酮中的弱氢键、卤素键及π堆叠相互作用:来自实验与理论分析的见解
《CrystEngComm》:Deciphering weak hydrogen bonds, halogen bonds, and π-stacking interactions in two fluorinated 2′-hydroxychalcones: insights from experimental and theoretical analysis
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年10月02日 来源:CrystEngComm 2.6
编辑推荐:
本文合成了两个氟代2'-羟基查耳酮衍生物,通过FTIR、NMR及X射线晶体学确认结构,发现化合物1以C–H…O/F氢键和π堆积为主,化合物2含F…F卤键及π堆积。Hirshfeld表面分析显示H…H/O和H…F是主要堆积接触。理论计算(PIXEL)和DFT分析揭示了分子间相互作用机制。预测显示该类化合物具有高抗缺氧活性,并通过SwissADME软件评估了药代动力学和毒性特征。
在本文中,我们报道了两种氟化2′-羟基查尔酮衍生物(E-3-(4-氟苯基)-1-(2-羟基苯基)丙-2-烯-1-酮(1)和(E-1-(2-羟基苯基)-3-[(4-三氟甲基)苯基]丙-2-烯-1-酮(2)的合成、光谱学以及X射线表征。这些化合物是通过在碱性条件下,利用Claisen–Schmidt缩合反应将2′-羟基乙酰苯酮与4-氟苯甲醛和4-(三氟甲基)苯甲醛反应制得的,产率良好。其结构通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)、紫外-可见光谱以及1H和13C核磁共振(NMR)光谱得到了充分确认。晶体学分析表明,化合物1的超分子组装主要由C–H?O和C–H?F氢键控制,而在化合物2中观察到了C–H?O、F?F以及π-堆叠相互作用。Hirshfeld表面分析显示,H?H、H?O/O?H和H?F/F?H接触在两种化合物的晶体堆积中起主导作用。我们使用PIXEL程序计算了化合物1、2及其两种相关化合物的晶格能和分子间相互作用能。接触富集比显示这四种化合物的分子间相互作用最为有利。通过详细的密度泛函理论(DFT)计算分析了稳定晶体堆积的分子间相互作用的强度和性质。最后,利用PASSonline软件预测了这些化合物可能的药理效应、作用机制、代谢相关作用及毒性。所分析的四种2′-羟基查尔酮均表现出较强的抗缺氧活性。此外,还利用在线SwissADME软件预测了它们的药代动力学性质,包括吸收、分布、代谢、排泄和毒性特征。
生物通微信公众号
知名企业招聘