综述:为更有利于临床医生的新一代测序分子生物标志物报告制定共识:美国分子病理学协会和美国病理学家学会的联合共识建议
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时间:2025年10月02日
来源:The Journal of Molecular Diagnostics 3.4
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本文强烈推荐一份由权威专家团队制定的新一代测序(NGS)分子生物标志物报告模板。该模板旨在解决NGS报告解读复杂、利用率低的痛点,通过优化格式、信息排序和关键内容(如阴性结果、VUS解释)的呈现,显著提升报告对肿瘤医生(Oncologist)的友好度,最终助力精准医疗和改善患者护理。
癌症是一种复杂的疾病,其异质性细胞群的基因组中包含大量突变和结构变异,这对诊断、预后、治疗选择、治疗耐药性和疾病进展具有重要影响。虽然传统的单基因检测方法在临床中应用,但它们通常效率低下、成本高昂,并且会消耗有限的患者组织样本。下一代测序(NGS)已成为临床测试的主流方法,它能够高效地同时检测多个基因的变异。然而,尽管NGS基因panel分析日益普及,但已发表的报告表明其利用率仍然不足,其中一个关键障碍是缺乏能够协助解读测试结果的专业人士。因此,为NGS分子生物标志物报告建立一个共享的最佳实践模板,通过提高报告对医疗提供者和实验室专业人士的有效性和效率,可以促进更多机构引入和/或增加检测,从而改善患者护理。
为应对这一挑战,美国分子病理学协会(AMP)召集了一个多学科协作的专家工作组。该小组由来自美国的分子实验室专业人士、分子病理学家、病理学家和肿瘤内科医生组成,他们在肿瘤(包括非小细胞肺癌NSCLC)的NGS分析方面拥有丰富的专业知识和经验。一位在指南制定方面经验丰富的方法学家在整个项目过程中为小组提供了咨询。工作组的核心任务是审查现有报告,并利用当前报告指南和方法中的最佳实践,开发一个NGS生物标志物报告模板,以最优方式呈现复杂的分子谱信息,方便肿瘤医生和其他医疗提供者高效使用。
工作组收集并审查了来自公立、私人和学术实验室的共17份非小细胞肺癌(NSCLC)NGS生物标志物报告。审查的重点内容包括报告长度、是否存在总体摘要、生物标志物报告表的使用、颜色的有效运用、指南和临床试验信息的纳入、生物标志物背景介绍、是否包含足够的检测描述和性能特征、对意义不明确变异(VUS)的信息提供和解释,以及小组成员是否认为该报告对“肿瘤医生友好”。所有报告都针对这些元素进行了评估,并特别关注了那些能显著提高报告清晰度和可用性的设计选择。
治疗决策不仅基于存在的生物标志物,也基于特定改变的缺失。在许多情况下,如果没有特定的生物标志物,则不推荐使用特定的疗法。例如,在没有EGFR基因组改变的情况下,不建议使用EGFR抑制剂。而在另一些情况下,某种疗法仅在不存在特定改变时才有效。例如,在没有KRAS、NRAS或BRAF改变时,EGFR导向疗法是有效的。因此,在分子报告中清楚地传达“关键阴性”结果——即那些临床可操作基因被确认为野生型或未发生改变——是至关重要的一环,这能确保临床医生获得所有必要信息来为患者制定最合适的治疗策略。
尽管采用 provider-friendly 的生物标志物报告模板有许多潜在好处,但工作组也承认存在一些实施障碍。本工作组并未具体讨论如何将其操作性地整合到合并报告或包含结构化和/或系统报告元素的报告中,但意识到许多机构可能需要调整现有工作流程来纳入该模板。对基因组数据互操作性的分析超出了本项目的范围。此外,实验室信息系统(LIS)和电子病历(EMR)系统的可变性以及不同机构在报告生成和签署方面的工作流程差异,都可能成为广泛采用的挑战。
在吸纳了利益相关者和社区的反馈后,教育和信息传播被列为优先事项。最终确定的 provider-friendly 生物标志物报告模板和模拟NSCLC样本报告将提供免费下载。美国分子病理学协会(AMP)将举办网络研讨会并提供存档点播录制,向所有感兴趣的专业人士介绍该模板及其使用。工作组计划在未来评估该模板的实施情况和使用效果,并探索将其应用扩展到其他肿瘤类型(如结直肠癌、黑色素瘤、乳腺癌和中枢神经系统肿瘤)的可能性,最终目标是建立一个全面的、跨肿瘤类型的标准化报告框架。
AMP Oncologist-Friendly Biomarker Report Working Group 协作开发了一个初步的、对临床医生友好的实体瘤NGS分子生物标志物报告模板。该模板的制定基于小组成员集体的专业经验、现有报告范例、已建立的实践指南以及撰写时可获得的已发表证据。此外,模板还吸纳了通过顾问小组和公开评议期所达成的社区共识。该共识模板旨在优化分子病理学家和肿瘤学家之间的沟通,目标是促进更有效地利用复杂的分子谱信息,最终为患者带来更好的临床结局。
美国分子病理学协会(AMP)的临床实践指南和报告旨在为实验室和其他医疗保健专业人员提供特定实践领域的指导和建议。该指南或报告不应被视为包含所有适当的方法或途径,或排除其他方法。它们不能保证任何特定结果,也不构成护理标准。指南或报告完全基于专家对当时可获得科学证据的评估,旨在作为医疗保健专业人员在护理患者时运用判断力的辅助工具。
工作组感谢多位学科专家对本手稿开发做出的贡献,并感谢AMP员工和临床实践委员会领导层的持续支持。这项工作得到了AMP的资助。
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