利用一种新型聚芳酰胺纳米片对肺癌生物标志物进行计算探索,以期实现有效的检测方法

《Journal of Molecular Liquids》:A computational exploration of promising sensing of lung Cancer biomarkers using a novel polyaramid nanosheet

【字体: 时间:2025年10月02日 来源:Journal of Molecular Liquids 5.2

编辑推荐:

  本研究采用密度泛函理论(DFT)探究2DPA单层对肺癌生物标志物(P-甲基苯酚、丙醇、丙酮等)的吸附特性,计算吸附能及Hirshfeld电荷转移,发现2DPA对特定生物标志物具有高选择性,且能有效排除常见干扰气体(N?、O?、CO?、H?O),为开发非侵入式肺癌检测传感器提供理论依据。

  
Rezvan Rahimi|Mohammad Solimannejad|Zeynab Ehsanfar
伊朗阿拉克大学理学院化学系,阿拉克3848177584

摘要

本研究采用密度泛函理论(DFT)来探讨肺癌生物标志物在呼出气体中对聚芳酰胺单层(2DPA)的吸附行为。具体研究了P-甲酚、丙醇、丙酮、己醛、壬醛、甲醛和苯的吸附情况。此外,还确定了这些生物标志物在2DPA基底上最稳定的吸附构型。计算得出P-甲酚/2DPA、丙醇/2DPA、丙酮/2DPA、己醛/2DPA、壬醛/2DPA、甲醛/2DPA和苯/2DPA复合物的吸附能分别为?0.90、?0.86、?0.83、?0.82、?0.74和?0.51电子伏特。这些生物标志物与其在2DPA上的复合物之间的Hirshfeld电荷转移分别为0.02、0.08、0.05、0.02、0.39、0.04和0.02电子。除了研究目标肺癌生物标志物外,本研究还考察了呼出气体中四种常见干扰分子的吸附行为:氮气(N?)、氧气(O?)、二氧化碳(CO?)和水(H?O)。这一对比分析为聚芳酰胺单层(2DPA)作为传感平台的选择性提供了宝贵见解,并指出了使用过程中可能出现的潜在干扰因素。本研究中使用的2DPA具有独特的电子特性和φ型传感器特性,能够检测特定的肺癌生物标志物,如P-甲酚、己醛和壬醛。此外,2DPA单层在接触P-甲酚、丙醇、丙酮和己醛生物标志物时表现出适当的吸附能、显著的电子属性变化以及合适的恢复时间。因此,这种传感器可以通过分析呼出气体快速识别肺癌,从而促进早期治疗并改善患者预后。

引言

全球癌症形势面临严峻挑战,其中肺癌(LC)是一个主要威胁。世界卫生组织(WHO)报告称,肺癌是仅次于乳腺癌的第二大常见癌症类型,也是全球癌症相关死亡的主要原因。早期诊断肺癌对于提高生存率和在癌症扩散前开始有效治疗至关重要[1]。许多关于早期恶性转化的研究为提高癌症检测和治疗提供了启示[1,2]。物理治疗方法已被证明对多种癌症(包括肝癌、肺癌、肠癌和乳腺癌)有效,尤其是在早期诊断的情况下[[3], [4], [5]]。早期癌症检测可以显著提高生存机会,肺癌的生存率为60%,乳腺癌为100%[5]。目前的诊断方法存在一些不足,这些不足阻碍了疾病的有效检测。此外,这些方法在早期检测肺癌肿瘤方面往往能力有限,因为它们依赖于肿瘤的物理和表型特征[[6], [7], [8]]。侵入性技术在诊断早期肺癌时也面临类似挑战[6]。因此,人们越来越关注基于生物标志物测量的癌症诊断方法的发展。在癌症患者体内(包括体液和呼出气体)发现了多种癌症生物标志物[[9], [10], [11]]。挥发性有机化合物(VOCs)是重要的癌症生物标志物,在癌症患者的体液和呼出气体中表现出明显的浓度差异。这些差异为改进癌症检测和监测提供了可能性,为更有效和个性化的治疗方案铺平了道路[[12], [13], [14], [15]]。
2D纳米材料已被研究用于多种应用,包括传感器[16]、能量存储[17]和药物输送[18]。许多理论研究探讨了使用新一代2D纳米片(如Mexene和过渡金属硫属化合物(TMDs)[19], [20], [21], [22], [23], [24], [25], [26], [27], [28]]对肺癌生物标志物的吸附和传感性能。在生物医学应用背景下,必须解决关于二维(2D)材料使用的一些问题,包括其生物降解性、生物相容性和潜在毒性。此外,还有关于这些材料的稳定性、制备复杂性、水溶性和可扩展性的问题。然而,需要注意的是,在传感应用方面[[29], [30], [31]],除非打算植入制造的传感器,否则不必过分担心毒性和生物相容性问题。
最近,成功合成了一种称为聚芳酰胺(2DPA)的二维共价生长聚合物[32,33]。2DPA系统表现出优异的机械性能,强度几乎是结构钢的两倍,具有用于轻质复合材料的潜力。由于其独特特性,2DPA可用作气体选择性膜进行气体分离[32,33]、能量存储平台[[34], [35], [36], [37]]、传感器[38]以及药物输送系统[39]。本研究的目的是首次验证合成2DPA检测潜在肺癌生物标志物的能力。使用原始2DPA检测这些生物标志物的主要优势在于无需进行任何结构修饰(如装饰或掺杂),这对于实际应用尤为重要,因为工程纳米材料的制备是一个复杂且具有挑战性的过程。

计算方法

所有DFT计算都是通过Materials Studio软件套件中的DMol3模块完成的[[41], [42], [43]]。本研究采用了基于广义梯度近似(GGA)框架的Perdew-Burke-Ernzerhof(PBE)公式进行交换相关函数计算[44]。同时,我们还引入了双数值极化函数(DNP)。Grimme的DFT-D方法结合了范德华力

结果与讨论

在优化2DPA单层之前,初始优化过程涉及参数k点、轨道截止和晶格参数。优化后的2DPA超胞包含48个C原子、24个H原子、24个N原子和12个O原子,如图1a和b所示。图1c展示了优化后的生物标志物分子结构。2DPA单层由三种类型的环组成,分别标记为1–3。这些环是生物标志物分子可能的吸附位置

结论

本研究旨在探讨使用2DPA单层来检测肺癌生物标志物,重点关注选择性和灵敏度。我们研究了七种生物标志物,包括P-甲酚、丙醇、丙酮、己醛、壬醛、甲醛和苯。我们探索了将肺癌生物标志物吸附到原始2DPA单层上的不同位置,并对最稳定的吸附构型进行了电子属性和分子动力学分析

CRediT作者贡献声明

Rezvan Rahimi:撰写——初稿、软件开发、实验研究。Mohammad Solimannejad:撰写——审阅与编辑、验证、概念构思。Zeynab Ehsanfar:撰写——审阅与编辑、验证。

伦理批准

不适用。

资金支持

本研究未获得任何资金支持。

利益冲突声明

作者声明他们没有已知的可能会影响本文研究工作的财务利益或个人关系。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号