呼吸道合胞病毒（RSV）感染后儿童与成人微生物组的显著差异及其与宿主应答的关联研究

本研究通过16S rRNA测序与转录组分析，揭示RSV感染后儿童与成人咽部微生物组（如普雷沃菌属/韦荣球菌属）的差异分布特征，发现儿童住院患者中α-变形菌纲与中性粒细胞趋化因子（CXCL10/CXCL11）的正向关联，为儿童RSV高致病性的免疫-微生物互作机制提供新视角。

　　

研究亮点

Study population and sample collection

研究人群与样本采集

患者与健康对照（HC）于2019年11月至2023年6月期间从中日友好医院和淄博市立医院招募。社区获得性肺炎（CAP）诊断依据美国感染病学会与美国胸科学会指南。共采集223份咽拭子样本，包括30例成人RSV患者、92例儿童RSV患者、51例CAP患者及50例HC。后续分析中排除2名儿童样本。

Difference on pharyngeal microbiota of adult RSV patients compared with CAP patients and HC

成人RSV患者与CAP患者及HC的咽部微生物组差异

与HC相比，RSV患者的Chao1指数和Shannon指数显著降低（图1A、B），表明细菌丰富度和均匀性下降。Beta多样性分析显示三组间微生物组存在显著分化（R²=0.24, p=0.001）。成人住院与门诊患者间微生物组成无显著差异。

Discussion

讨论

呼吸道微生物组在感染进程中起关键作用。本研究发现儿童RSV住院患者咽部厌氧菌（如普雷沃菌属和韦荣球菌属）丰度高于门诊患者，且其转录组差异更显著，主要涉及中性粒细胞趋化与迁移通路。α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）与放线菌纲（Actinobacteria）与CXCL10/CXCL11表达呈正相关，提示微生物可能通过调节中性粒细胞募集参与儿童重症炎症反应。

Conclusion

结论

RSV患者口腔厌氧菌丰度低于CAP患者及HC。儿童患者表现出比成人更显著的咽部菌群失调和宿主应答，住院患儿口腔厌氧菌减少而中性粒细胞浸润增强。本研究阐明微生物组组成与代谢物可能通过调控中性粒细胞功能影响RSV致病性。