DNA甲基化介导转移性子宫内膜透明细胞癌免疫抑制肿瘤微环境的机制研究
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时间:2025年10月02日
来源:eBioMedicine 10.8
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为解决子宫内膜透明细胞癌(ECCC)转移机制不明、缺乏有效预测标志物和治疗靶点的问题,研究人员开展多中心整合多组学研究,发现DNA甲基化通过靶向ETS1结合位点和TCR信号通路关键基因(如LCK、CD3E、ZAP70)重塑免疫抑制微环境,构建了基于TIL密度和LCK甲基化的转移风险评分模型(AUC=0.859),为ECCC精准防治提供新策略。
子宫内膜透明细胞癌(Endometrial Clear Cell Carcinoma, ECCC)是一种罕见但高度侵袭性的子宫内膜癌亚型,约占所有子宫内膜癌病例的2%–5%。尽管其发病率较低,但ECCC具有显著的转移倾向,约40%–50%的早期患者在疾病进展中会发生转移,导致5年总生存率降至25%以下,临床预后极差。目前,ECCC的分子机制尚未明确,缺乏有效的预测生物标志物和特异性治疗策略,尤其是其转移过程中的免疫微环境调控机制更是研究的空白领域。随着精准医学的发展,分子分型已成为子宫内膜癌预后分层和治疗决策的重要依据,但超过85%的ECCC病例属于预后较差的NSMP(无特定分子谱)或p53abn(p53异常)亚型,这些肿瘤通常对免疫检查点抑制剂(ICB)反应不佳, due to inherently low immunogenicity。因此,阐明ECCC转移的分子驱动机制,并探索新的治疗靶点,成为改善患者预后的关键。
为了深入解析ECCC的转移机制,研究人员开展了一项多中心回顾性研究,纳来自6家医疗中心的51例ECCC患者,并建立了两个独立队列:测序队列(n=35)用于全基因组甲基化测序(GM-seq)和转录组测序(RNA-seq)的整合分析,以及组织微阵列(TMA)队列(n=16)用于关键发现的验证。研究通过多组学数据整合分析,结合生物信息学挖掘、免疫组织化学(IHC)、多重免疫荧光(mIF)染色和生存分析等技术,系统比较了转移性(Pm)和非转移性(Pn)原发肿瘤的分子特征,旨在揭示DNA甲基化在ECCC转移中的调控作用,并开发潜在的临床预测模型。
研究首先通过转录组分析发现,Pm肿瘤存在显著的基因表达失调,涉及胚胎器官发育、细胞外基质组织以及免疫反应相关通路的抑制。特别是,Pm肿瘤表现出免疫冷表型,肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)密度降低,关键抗肿瘤免疫细胞(如CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和NK细胞)浸润减少,同时三级淋巴结构(TLS)形成受损。全基因组甲基化分析进一步揭示,Pm肿瘤中存在广泛的甲基化重编程,其中启动子区域超甲基化显著富集于免疫相关通路,如T细胞受体(TCR)信号通路、淋巴细胞激活和细胞因子反应等。功能富集分析表明,超甲基化差异甲基化基因(DMG)与免疫抑制微环境的形成密切相关。
机制上,研究发现DNA甲基化通过靶向转录因子ETS1的结合位点,调控其调节子(regulon)活性,进而影响T细胞激活和分化相关基因的表达。同时,TCR信号通路关键基因(如LCK、CD3E、ZAP70)的甲基化沉默导致T细胞功能受损,削弱抗肿瘤免疫应答。这些发现通过甲基化-表达相关性分析、转录调控网络构建以及IHC验证得到证实。基于这些发现,研究利用LASSO回归构建了一个转移风险评分模型,整合TIL密度和LCK甲基化水平,该模型在预测ECCC转移方面表现出色(AUC=0.859),并能有效分层患者生存风险。
研究结论强调,DNA甲基化介导的“表观遗传-免疫轴”是ECCC转移的核心机制,通过系统性沉默免疫应答基因,重塑免疫抑制微环境,从而促进肿瘤转移。所开发的转移风险模型和关键靶点(如LCK)的发现,不仅为ECCC的早期风险分层提供了实用工具,还为联合表观遗传治疗和免疫治疗提供了新思路。论文发表于《eBioMedicine》,其成果对推动ECCC精准医学发展具有重要意义,尤其为免疫冷肿瘤的治疗策略提供了理论依据和实践方向。
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