《Natural Product Research》:Comparative study on the inhibitory potential of anticancer drugs and natural compounds against PHB proteins
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基于结构的药物重定向方法筛选出Ibrutinib等6种抑制prohibitin 1/2(PHB1/PHB2)的候选药物,分子对接显示Ibrutinib对PHB1和PHB2的结合能分别达-92.1和-71.6 kJ/mol,分子动力学模拟证实其复合物稳定性高(RMSD~1.3-2.2 ?)。
Varshini Pillai | Gnanaprakash Jeyaraj | Thirumurthy Madhavan | Megala Jayaraman
印度泰米尔纳德邦金奈Kattankulathur市SRM科学技术学院工程与技术学院遗传工程系
摘要
Prohibitin 1(PHB1)和Prohibitin 2(PHB2)在肿瘤发生过程中起着关键作用,是抗癌治疗的新靶点。本研究采用基于结构的药物再利用方法,通过分子对接技术筛选了35种化疗药物和天然化合物对PHB1和PHB2的结合能力。其中六种候选药物——伊布替尼(Ibrutinib)、多柔比星(Daunorubicin)、多西他赛(Doxorubicin)、芸香苷(Rutin)、黄酮吡啶醇(Flavopiridol)和喜树碱(Camptothecin)的结合亲和力范围为?9.7至?10.5 kcal/mol。ADMET分析表明伊布替尼和黄酮吡啶醇具有类似药物的特性,并且药代动力学表现良好,而芸香苷不符合Lipinski规则。200纳秒的分子动力学模拟显示伊布替尼与PHB复合物具有较高的稳定性,其RMSD值较低(约1.3–2.2 ?)。MM/PBSA自由能计算进一步证实伊布替尼是这两种蛋白最强的结合剂(与PHB1和PHB2的结合自由能分别为?92.1和?71.6 kcal/mol)。这些研究结果表明伊布替尼是一种有前景的针对PHB的抗癌治疗药物。进一步的体外和体内验证对于确认其治疗潜力至关重要。