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探索虚拟设计的新喹唑啉衍生物作为EGFR抑制剂的抗癌潜力:一种计算机模拟方法
《Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine》:Exploring Anticancer Potential of Virtually Designed Novel Quinazoline Derivatives as EGFR Inhibitors: An In-silico Approach
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年10月03日 来源:Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine
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单核苷酸多态性研究揭示CACNA1C基因14个致病性变异及其结构功能特征。通过多工具联合分析鉴定出1824个非同义SNP中14个有害突变,涉及蛋白结构稳定性、基因互作及磷酸化位点改变,为疾病治疗提供新靶点。
引言:CACNA1C基因是一种电压门控钙通道,参与调节钙离子进入细胞的过程。该基因与多种疾病相关,如癌症、精神分裂症、双相情感障碍、焦虑症、幻牙痛和糖尿病性周围神经病变。
目的:本研究旨在利用生物信息学工具探究与人类CACNA1C基因相关的错义单核苷酸多态性。
目标:本研究通过多种生物信息学工具,探讨CACNA1C基因高风险错义单核苷酸多态性的结构和功能特征。
方法:从NCBI和Uniprot数据库中检索CACNA1C基因的错义单核苷酸多态性(nsSNPs)。使用SIFT、Polyphen v2、PROVEAN、Panther、PHD-SNP和SNPs & GO等工具识别有害的nsSNPs。通过I-Mutant和MUPro检测基因的结构稳定性。GeneMANIA和STRING提供了基因-基因及蛋白质-蛋白质相互作用的详细信息。此外,还利用SOPMA、AlphaFold和NetPhos 3.1进行了功能分析。
结果与讨论:在1824个非同义错义SNPs中,有14个被鉴定为有害的nsSNPs。这些SNPs包括rs34534613、rs79891110、rs80315385、rs199473391、rs199586997、rs200935321、rs368861681、rs369421219、rs370634418、rs376872233、rs377564636、rs200325545、rs267603426和rs372495864。对这些SNPs进行了IMutant 2.0、MUPro、GeneMANIA、STRING、SOPMA、AlphaFold和NetPhos 3.1等工具的结构和功能分析。
结论:我们的研究发现14个nsSNPs对CACNA1C基因的结构和功能具有负面影响。这些SNPs可能成为疾病诊断的潜在治疗靶点。
关键词: CACNA1C, 有害nsSNPs, 计算机模拟(in silico), 错义SNP, 单核苷酸多态性, 多态性.
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