综述:玉米杂交种籽粒产量稳定性直接基因组预测的高效策略
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时间:2025年10月04日
来源:Euphytica 1.7
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本文系统评估了直接预测单交玉米杂交种稳定性(G×E)的基因组选择(GP)策略。通过贝叶斯岭回归模型分析多环境数据,发现Wricke生态价指数与基因型主效应预测性能最优,平均较传统多环境方法提升29.7%准确率(ACC),为热带农业抗逆育种提供高效计算方案。
研究背景
基因型与环境互作(G×E)效应是热带农业中影响玉米杂交种稳定性的核心挑战。传统多环境基因组预测(GP)虽能提升育种准确性,但存在计算强度大、耗时长的局限性。本研究提出直接通过稳定性指数预测单交玉米杂交种表现的新策略,旨在突破现有技术瓶颈。
材料与方法
研究采用128个单交玉米杂交种在6个环境中的平衡数据集,计算了包括Wricke生态价指数、欧几里得距离(Euclidian Distance)、育种值相对性能调和平均数(MHPRVG)在内的9种稳定性指标。采用贝叶斯岭回归(Bayesian Ridge Regression)模型进行基因组预测,并通过10轮十折交叉验证评估预测能力(PA)与准确率(ACC)。
结果分析
9项指数中有7项表现出令人满意的预测性能,其中PA范围0.17–0.31,ACC范围0.33–0.61。Wricke生态价指数与基因型主效应预测表现最为突出,其ACC均值显著高于贝叶斯多环境方法29.7%。研究指出MHPRVG和欧几里得距离指数在大规模数据集应用中更具潜力。
应用前景
该策略为高通量基因组选择提供了计算效率优化方案,尤其适用于热带地区抗逆育种程序。通过直接预测稳定性参数,可加速适应复杂环境变化的高产稳产杂交种选育进程,为粮食安全提供技术支撑。
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