解构Acinetobacter guillouiae CE15全基因组：揭示竹材微生物降解新机制

本研究报道了从腐烂竹秆中分离的Acinetobacter guillouiae CE15菌株的完整基因组序列（4,661,234 bp，GC含量38.29%，含4,220个蛋白编码基因），为探索细菌介导的竹材生物降解机制及该菌株的芳香化合物代谢潜力提供了重要遗传基础。

　　

在潮湿温暖环境中，竹材易受多种微生物侵蚀导致霉变腐朽。尽管真菌的作用已被广泛认知，但细菌在竹材生物降解过程中的角色仍属未知。革兰阴性菌属Acinetobacter（不动杆菌属）以其高度的代谢多样性和生理异质性著称，部分菌种甚至能降解芳香化合物并适应极端环境。

菌株CE15于2023年3月采自浙江农林大学校园（119°44′01′′E, 30°15′29′′N）的腐烂竹样，通过竹材提取液（50g鲜竹秆+1L蒸馏水煮沸10分钟）分离纯化。其16S rDNA序列（GenBank登录号PP702142）与Acinetobacter guillouiae CIP 63.46相似度达99.18%。

研究人员使用Illumina Novaseq 6000平台（产生7,970,019×2条读长，Q30值92.311%）和牛津纳米孔PromethION平台（获得104,084条读长，平均长度9,511.4 bp）进行联合测序。原始数据经fastp剪切、Porechop修剪（质量阈值Q5）和Guppy碱基识别处理，最终通过Unicycler组装成一条完整染色体（无质粒）。该基因组总长4,661,234 bp，GC含量38.29%，包含4,220个蛋白编码基因、81个tRNA基因和21个rRNA基因。注释工作由NCBI原核基因组注释管道（PGAP）和RAST服务器完成。

该研究为探索竹材生物降解的微生物机制及开发基于细菌代谢的生物技术提供了重要遗传资源。