温度梯度下南非角海胆(Parechinus angulosus)肠道微生物多样性及其与宿主全基因组变异的关联研究
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时间:2025年10月05日
来源:Austral Ecology 1.6
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本研究通过16S rRNA代谢条形码与ezRAD测序技术,解析了南非角海胆肠道菌群的空间分异规律及其与宿主基因组变异的关联。研究发现细菌群落β多样性存在显著地理差异,且与距离衰减效应相关,但宿主基因组结构未呈现显著种群分化,表明驱动宿主遗传变异与菌群组成的因素具有独立性。
海洋细菌构成了海洋生物量的主体。多样化的微生物群落定殖于不同生物器官中,其遗传多样性及生化功能对宿主的适应性与生态系统状态具有关键作用。本研究以南非广泛分布的角海胆(Parechinus angulosus)为模型,探究其肠道菌群组成的地理分异规律及与宿主基因组变异的关联。通过16S rRNA(16S ribosomal RNA)代谢条形码和ezRAD(ezRAD sequencing)测序技术,鉴定出20个门(Phylum)、39个纲(Class)、89个目(Order)、128个科(Family)及191个属(Genus)的细菌类群。尽管α(Alpha)多样性在西部与南部海岸生物区无显著差异,但β(Beta)多样性分析显示两区域菌群组成存在显著分化。距离衰减分析表明,地理距离与细菌群落差异度呈显著正相关。宿主基因组分析未检测到显著种群结构,且经地理距离校正后,基因组距离与菌群差异无显著相关性。微生物聚类树与宿主基因组系统发育拓扑结构不一致,提示影响宿主基因组结构的因素并不直接调控其肠道菌群的组成。该研究为揭示海洋生物与共生微生物群的复杂互作机制提供了重要理论基础。
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