综述:应激颗粒(SGs)与处理小体(PBs)解组装的新兴趋势
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时间:2025年10月06日
来源:Cell Reports 6.9
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本综述系统总结了应激颗粒(SGs)和处理小体(PBs)这两种无膜细胞器的动态组装与解组装机制,重点探讨了其通过清除(clearance)和主动拆解(disassembly)两种路径的调控方式。文章强调了翻译抑制、液相分离(LLPS)、翻译后修饰(PTM)及分子伴侣等关键因素的作用,并深入解析了异常RNP凝聚体在神经退行性疾病(如ALS)和癌症中的病理意义,为靶向 condensate 动态过程的治疗策略提供了重要见解。
应激颗粒与处理小体的动态生命周期
细胞内部存在多种由蛋白质和RNA通过弱价键相互作用形成的无膜细胞器,其中应激颗粒(Stress Granules, SGs)和处理小体(Processing Bodies, PBs)作为典型的核糖核蛋白(RNP)凝聚体,广泛参与mRNA的储存、降解和翻译调控。近年来,这些动态结构的组装机制已得到较深入的研究,而它们的解组装过程——尤其是在应激消退后如何有序解散并恢复细胞稳态——逐渐成为新的研究焦点。
SGs与PBs的组装与基本特征
应激颗粒通常在热休克、氧化应激或渗透压变化等条件下诱导形成,其核心成分包括翻译停滞的mRNA、RNA结合蛋白(如G3BP1、TIA1)以及多种翻译起始因子。它们通过液相分离(Liquid-Liquid Phase Separation, LLPS)机制聚集而成,具有高度动态性。处理小体则常态存在于细胞中,应激时数量增多,是mRNA降解、翻译抑制的重要场所,关键蛋白包括Dcp1/2、Edc3和Lsm1-7等。
两者的组装均依赖于多价相互作用,包括RNA-RNA、RNA-蛋白质和蛋白质-蛋白质之间的相互作用。例如,G3BP1通过其固有无序区(IDR)和RGG motif与其他蛋白或RNA发生相互作用,促使SGs成核和生长。类似地,PBs的组装则涉及Dhh1(Ddx6)、Edc3和Pat1等蛋白的协同作用。
解组装的两种主要途径:清除与主动拆解
RNP凝聚体的解组装主要通过两种方式进行:清除(clearance)和主动拆解(disassembly)。清除途径依赖细胞自噬(autophagy)或蛋白酶体系统(proteasomal system)降解整个凝聚体或其组分。例如,自噬受体p62和NDP52可识别甲基化蛋白并引导SGs和PBs进入自噬降解途径。此外,蛋白酶体途径中的ZFAND1等蛋白也能介导SGs的清除。
值得注意的是,清除过程可能需要先部分拆解凝聚体,以便降解机制更好地接触其内部组分。例如,酵母中的Rim4淀粉样结构需先解聚才能被蛋白酶体降解。
主动拆解则是一种高度调控的过程,涉及应激消退后凝聚体组分的逐步释放和再分配。该过程可通过以下机制实现:
逆转组装过程
应激期间,通过整合应激反应(ISR)通路激酶(如PKR、PERK)磷酸化eIF2α,抑制翻译起始,促进SGs和PBs组装。应激消退后,eIF2α去磷酸化恢复翻译,mRNA被重新招募至核糖体,导致凝聚体内RNA浓度低于相分离饱和浓度(Csat),从而触发解组装。化合物如海藻糖(trehalose)可通过调节p-eIF2α水平直接影响SGs解组装。
翻译后修饰(PTM)在调控解组装中发挥重要作用。例如,G3BP1的多个位点磷酸化、甲基化和乙酰化修饰可改变其RNA结合能力或相互作用价数,从而调控其从SGs中的释放。酪蛋白激酶2(CK2)介导的G3BP1 S149位点磷酸化、PRMT1/5调控的RGG motif甲基化,以及CBP/p300介导的K376乙酰化,均被证实与SGs动态解散相关。
主动调控的拆解程序
细胞还通过招募特定拆解相关蛋白(disassembly engaged proteins, DEPs)主动促进解组装。例如,FAK激酶激活后磷酸化Grb7,削弱其与SG组分(如HuR、TIA1)的相互作用,破坏SGs完整性。ULK1/2激酶通过磷酸化VCP(p97)促进G3BP1、TDP43等蛋白从SGs中释放。此外,ATP酶(如Hsp104、Dhh1)和RNA解旋酶(如DDX3X)能利用ATP水解活性破坏RNA-蛋白质或RNA-RNA相互作用,促使凝聚体解散。
在酵母中,含有RGG motif的蛋白Sbp1可与Edc3竞争性结合,干扰PBs的核心相互作用网络,诱导其解组装。类似地,人类中的微蛋白NoBody(NBDY)通过抑制EDC4的自关联,特异性促使PBs解散。
结构域与无序区的协同调控
固有无序区(IDR)和结构化结构域在解组装中均扮演关键角色。IDRs(如RGG、LCD)通过其动态相互作用促进相分离,而PTM(如磷酸化、甲基化)可迅速改变IDR的相互作用能力,促使解组装。结构化域则常具备酶活性(如激酶、ATP酶)或作为蛋白互作平台,例如DEAD-box解旋酶通过重塑RNP复合物促进RNA释放,DYRK3激酶通过磷酸化SG成分弱化多价相互作用。
解组装的生理与病理意义
及时的解组装对维持细胞稳态至关重要。例如,Sky1激酶缺陷会导致酵母应激后生长延迟,hnRNPA2B1缺失的小鼠表现出生育障碍和SG解组装过快。在神经元中,RNP凝聚体的动态调控对于轴突再生和突触功能至关重要。例如,破坏G3BP1颗粒可促进轴突翻译和再生修复。
异常的解组装过程与多种疾病密切相关。在神经退行性疾病(如肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD))中,TDP43、FUS等蛋白的突变导致其滞留在SGs中,形成不可逆的病理聚集体。在癌症中,化疗诱导的SGs可通过抑制凋亡信号促进肿瘤细胞存活和耐药性。因此,靶向解组装过程——如利用karyopherin-β2促进FUS核重新定位,或使用RGG肽段溶解TDP43凝聚体——已成为潜在的治疗策略。
总结与展望
当前研究尚处于起步阶段,许多关键问题仍未解答。例如,不同应激条件下SGs和PBs的解组装机制是否存在差异?代谢物和小分子(如ATP、SAM)如何调控PTM酶的活性和解组装过程?此外,大多数研究集中于G3BP1相关的SGs,其他组分和PBs的解组装机制仍需系统探索。未来通过化学生物学、代谢组学和高分辨率动态成像技术,有望揭示解组装过程的精细调控网络,为治疗ALS、癌症等疾病提供新靶点。
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