鲮鱼性腺转录组解析:性别相关基因的发掘与功能研究

【字体: 时间:2025年10月06日 来源:Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics 2.2

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  本综述首次对鲮鱼(Cirrhina molitorella)雌雄个体性腺进行转录组比较分析,成功组装64,954个unigenes并鉴定20,310个差异表达基因(DEGs),包括睾丸高表达基因16,003个和卵巢高表达基因4,307个。研究通过qPCR验证基因表达模式,填补了鲮鱼性别决定与性腺发育分子机制的空白,为水产养殖育种提供关键理论基础(如cyp19a1a、foxl2、dmrt1等基因功能解析)。

  
Highlight
材料来源
本研究从广州南沙水产养殖公园采集了3尾2龄雌性鲮鱼和3尾雄性鲮鱼样本。所有个体均来自经过多代选育的同一亲本批次,遗传背景相对一致,且养殖环境相同,确保生长条件一致。雌鱼卵巢与雄鱼睾丸通过形态学和组织学鉴定确认。
Illumina测序与组装结果摘要
本次组装基于6尾成鱼(3卵巢+3睾丸)的cDNA文库。质控后获得36.55 GB清洁读数,平均每文库6.09 GB,Q20值97.38%,Q30值92.77%。重新组装后共获得64,954个unigenes,总长度80,808,601 bp。单个unigene的N50为1,845 bp,平均长度1,244 bp。
讨论
本研究首次报道了鲮鱼雌雄性腺转录组测序结果。共获得64,954个unigenes,数量少于多数性腺转录组研究(如S. hollandi、S. barcoo和C. whiteheadi)。此外,32,720个unigenes通过功能注释被鉴定。差异表达分析显示睾丸中16,003个基因显著上调,卵巢中4,307个基因高表达。这些差异基因富集于类固醇合成、卵母细胞减数分裂等通路。关键性别相关基因(如cyp19a1a、foxl2、dmrt1)的表达模式与其他鱼类一致,表明其在性腺发育中的功能保守性。
结论
本研究首次揭示了鲮鱼性腺转录组特征。基于卵巢与睾丸转录组数据,共鉴定64,954个unigenes,并解析了性别偏好基因的表达模式。这些关键性别相关基因在鲮鱼中表现出与其他鱼类类似的表达特征,表明其在卵巢和睾丸发育、配子形成过程中功能保守。研究成果为鲮鱼性别决定机制和性腺发育研究提供了重要分子基础。
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