理论计算揭示铜(II)β-丙氨酸异羟肟酸12-金属冠醚-4与3-羟基-4-吡啶酮铜盐超分子组装的非共价作用机制及生物医学应用前景

【字体: 时间:2025年10月07日 来源:Computational Biology and Chemistry 3.1

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  本文通过DFT计算(密度泛函理论)揭示了铜(II)β-丙氨酸异羟肟酸12-金属冠醚-4(12-MC-4)与3-羟基-4-吡啶酮铜盐通过NH2?OC(O)氢键和Cu–O配位作用形成超分子组装体的机制,QTAIM(量子理论分子拓扑分析)和RDG(约化密度梯度)方法证实了非共价相互作用模式,为设计功能性生物材料(如抗菌/抗肿瘤药物载体)提供了理论依据。

  
Highlight
DFT计算预测含铜(II)的β-丙氨酸异羟肟酸12-金属冠醚-4(12-MC-4)与3-羟基-4-吡啶酮(3,4-HPs)铜盐衍生物可通过非共价相互作用形成分子组装体。通过QTAIM(量子理论分子拓扑分析)和RDG(约化密度梯度)方法分析表明,NH2?OC(O)型氢键和轴向Cu–O相互作用是关键接触方式。ELF(电子定域化函数)揭示了12-MC-4与铜盐中中心Cu2+离子配位环境的差异。研究进一步提出了晶体相中组装体可能的一维(1D)和二维(2D)堆积模式,并基于NH2?OC(O)和Cu–O相互作用的空间结构及计算的偶极矩进行了预测。在甲醇极性介质中,由单独12-MC-4和铜盐形成对应分子组装体的能量变化经PBE0/DGDZVP计算分别为0.7和?19.2 kcal/mol,并与相同基组下TPSSH计算结果进行了对比。
Computational details
配合物12采用密度泛函理论(DFT)和Gaussian 09程序包进行研究。使用DGDZVP基组在默认收敛标准下完成全几何优化,该基组此前已成功应用于多核异羟肟酸配合物研究。采用两种不同哈特里-福克交换比例的杂化泛函PBE0(25%)和TPSSH(10%)以评估其对相对能量的影响。
Results and discussion
DFT优化结构显示12中12-MC-4平台与3,4-HPs铜盐衍生物通过多种分子间作用力发生柔性结合。组装体中金属冠醚板块较单独12-MC-4物种呈现更明显凹形结构。在[CuII(L1)2]2?离子中,吡啶酮环与方形(O,O)Cu(O,O)配位平面均发生扭转,而羧酸根基团则通过NH2?OC(O)氢键与12-MC-4结合。
Conclusions
总结表明,DFT计算预测[12-MC-4]2+平台与3,4-HPs阴离子铜盐衍生物的组装主要由NH2?OC(O)分子间作用和轴向Cu–O接触驱动,并通过QTAIM和RDG予以识别。对于组装体12,PBE0泛函给出的NH2?OC(O)作用能及 equatorial Cu–O键能均高于TPSSH,而TPSSH对2中轴向Cu–O相互作用的能量预测高于PBE0。
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