利用环境和生物阈值对西尼罗河病毒的生态位及风险进行建模

《Archives of Microbiology》：Ecological niche and risk modeling of West Nile virus using environmental and biological thresholds

本研究通过整合NCBI病毒库长期数据与气候信息，利用随机森林构建物种特异性生态位模型，筛选出8种高预测性能（AUC>0.7）的蚊媒及鸟类宿主。空间风险评估显示，30-35°C温度与0-100mm降水条件下宿主重叠显著，揭示西尼罗病毒传播的生态阈值，强调气候变化下需结合气候敏感性与物种特异性策略优化监测与防控。

　　

摘要

管理病原体爆发仍然是一个重大挑战。本研究旨在通过整合长期病毒数据与气候信息，来评估西尼罗河病毒（WNV）传播的生态阈值。我们分析了从NCBI Virus数据库中获取的WNV序列及其相关的气候变量，重点关注与蚊子媒介和鸟类宿主相关的样本。利用基于随机森林的物种特异性生态位模型，我们确定了8种具有高预测性能的媒介和鸟类物种（AUC > 0.7）。这些模型被整合到一个空间风险框架中，以突出最有利于WNV传播的条件。风险峰值出现在温度在30至35°C之间、降水量在0至100毫米之间的区域，此时媒介和鸟类宿主存在重叠。我们的研究结果强调了虫媒病毒系统的生态复杂性，以及在变化的气候条件下，将对气候敏感的物种级信息纳入监测和控制策略中的重要性。